[0089] (2)经过冰箱冷冻保存30天后的狗牙根叶片对照组:在_80°C条件下,冷冻保存 30天后,称取狗牙根叶片0. 2g放入液氮预冷过的研钵中,加入液氮至浆状,移入2ml离心管 中(标记为4)。
[0090] (3)新鲜狗牙根叶片对照组:称取新鲜的狗牙根叶片0.2g放入液氮预冷过的研钵 中,加入液氮至浆状,移入2ml离心管中(标记为5)。
[0091] (4)分别往1-5号离心管中加入65°C预热的800μ1的SDS提取液,振荡混匀后, 在 65°C水浴 30min。
[0092] (5) 65°C水浴30min后,加入200μ1 5M的醋酸钠溶液,混匀后水浴20-30min,不时 震动以免成团。
[0093] (6)加入体积比为24:1的氯仿-异戊醇800μ1,充分混匀,在室温下,10000r/min 离心5min〇
[0094] (7)将上清液转移至另一 2ml的离心管中,加入_20°C预冷的0· 6-1. 0倍体积的异 丙醇,缓慢混匀,使DNA呈线团状沉淀析出。
[0095] (8) 1000(^/1^11离心31^11,弃去上清液,加入70%的乙醇洗涤,吹干。
[0096] (9)加入适量TE缓冲液(10mmol/LTris-HCl,lmmol/LEDTA,pH= 8. 0)溶解,加 入1/10体积的RNaSeA(10mg/ml),37°C条件下恒温lh,出去RNA;并置于-20°c冰箱中保存 备用。
[0097] (10)采用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计法检测(6)中狗牙根叶片所提取的 DNA的纯度。
[0098] (11)采用狗牙根SSR引物SC49对步骤(9)中狗牙根叶片基因组DNA的可靠 性进行PCR验证,SSR引物SC49序列为上游:5' -CAAGGACCACATCACCATCA-3',下游: 5' -CGGCCATTGATTATCTGTGA-3'。
[0099]PCR扩增体系为(20μ1) :Mg2+(l.Ommol.LMgCU1. 5μ1,10XPCRBuffer2μ1, 0· 2mmol·LMNTPs0· 3μ1,Taq酶(5U·μ1 30. 2μ1,0· 4ymmol·L1引物 3μ1,模板 DNA3yl,ddH20 10μ1。PCR反应程序为:95°C预变性 5min,94°C变性 30s,55°C退火 30s, 72°C延伸40s,循环36次,72°C延伸7min,4°C保存。
[0100] 实验结果
[0101] (1)采用紫外分光光度计法检测狗牙根叶片基因组DNA的纯度,基因组DNA的 A260/A280和A260/A230的比值,并对其进行比较,结果如表1所示,其中,1、2、3、4、5分别 为来自五种不同的狗牙根叶片所提取的基因组DNA(1 :实施例1所提供的保存液保存的狗 牙根叶片;2 :实施例2所提供的保存液保存的狗牙根叶片;3 :实施例3所提供的保存液保 存的狗牙根叶片;4 :冰箱冷冻保存的狗牙根叶片;5 :新鲜狗牙根叶片)。从表1中可知,五 种叶片所提取的基因组DNA的A260/A280都接近1. 8 ;经过实施例1-3 (表1组1、3)、冰箱 冷冻保存的叶片(表1组4)和新鲜叶片(表1组5)提供的保存液保存的叶片所提取的基 因组DNA的A260/A230都接近2. 0,说明这些方法保存的叶片的基因组DNA纯度较高;而经 过实施例1提供的保存液保存的叶片的A260/A230小于2 (表1组2),说明实施例2提供的 无氯仿保存液保存的狗牙根叶片所提取的DNA比值浓度偏低。
[0102] 表1SDS法提取狗牙根叶片基因组DNA紫外分光光度计检测结果
[0103]
[0104](2)各组琼脂糖凝胶电泳结果如图1所示(M为DNAMarker,TakaraDL2000bp),其 中,1、2、3、4、5分别为来自五种不同的狗牙根叶片所提取的基因组DNA(1 :实施例1所提供 的保存液保存的狗牙根叶片;2 :实施例2所提供的保存液保存的狗牙根叶片;3 :实施例3 所提供的保存液保存的狗牙根叶片;4 :冰箱冷冻保存的狗牙根叶片;5 :新鲜狗牙根叶片)。
[0105]由图1可知,相比实施例3(泳道3),经过实施例1和2提供的保存液保存的狗牙 根叶片所提取的DNA条带(即泳道1和2)较为模糊,有较多降解,其中实施例1保存液中 没有乙醇成分的DNA条带降解最明显。
[0106]而相比保存液中添加了氯仿成分的实施例1和3 (泳道1和3),保存液中没有添加 了氯仿成分的实施例2、以及新鲜采集的叶片、经冰箱-80°C保存的叶片的DNA点样孔处的 亮点较为明显(泳道2、4和5),DNA可能含有蛋白或糖类杂质;说明叶片保存时氯仿的存在 可以提高DNA纯度,降低蛋白或糖类等杂质。
[0107] (3)此外,本发明还采用实施例3的保存液,按照实施例3及6(1)-(9)的步骤,对 不同狗牙根种质叶片进行保存、以及DNA提取,并采用琼脂糖凝胶电泳检测叶片所提取的 DNA的纯度,采用聚丙烯酰氨凝胶电泳检测不同狗牙根种质SSR引物(SC49)PCR扩增产物 图。
[0108] 实验结果如图2所示(图2中,A和B中泳道1-12分别对应编号为1-12的不同 叶片材料。)图2-A为狗牙根叶片基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳图,其中,1-12分别为不同 种质的狗牙根叶片所提取的基因组DNA。图2-B是聚丙烯酰氨凝胶电泳检测12份不同种质 的狗牙根SSR引物(SC49)PCR扩增产物图。由图2可知,经过实施例3提供的保存液保存 的狗牙根叶片所提取的DNA能用于SSR引物扩增检测。
[0109] 实施例7
[0110] 为了进一步说明本发明的技术效果,本发明还采用实施例3的保存液,按照实施 例6 (1) - (9)的步骤,对结缕草和水稻进行保存、以及DNA提取,并采用琼脂糖凝胶电泳检测 结缕草叶片和水稻叶片所提取的DNA的纯度。
[0111] 实验结果
[0112] (1)对结缕草叶片所提取的DNA采用1. 0%的琼脂糖凝胶电泳分离,在紫外下成像 结果如图3所示,其中,1、2、3分别为不同结缕草种质叶片所提取的基因组DNA。
[0113] (2)对水稻叶片所提取的DNA采用1. 0 %的琼脂糖凝胶电泳检测,在紫外下成像结 果如图4所示,其中,1、2、3分别为不同水稻种质叶片所提取的基因组DNA。
[0114] 由图3和图4可知,经过实施例3提供的保存液保存的结缕草叶片和水稻叶片所 提取的DNA条带(参见泳道5)较为清晰,基本无降解,纯度较高。
[0115] 实施例8
[0116] 为了进一步说明本发明的技术效果,本发明还采用实施例3的保存液,按照实施 例6的步骤对柱花草叶片进行保存、以及DNA提取、分析。
[0117] 琼脂糖凝胶电泳结果如图5所示,泳道1-4为不同柱花草种质样品。由图5可知, 保存30天后的柱花草叶片DNA有明显降解,所提取的DNA浓度较低;所提取的DNA的蛋白 含量、糖、多酚类杂质含量偏高。说明对于多酚、多糖含量高的植物,需进一步摸索保存液的 配方、保存时间及保存条件,改进配方以期。
[0118] 本发明的适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片保存液及其保存方法用 于禾本科植物样品保存,不限于本发明实施例中的狗牙根、结缕草、水稻叶片。
[0119] 以上所述,仅为本发明较佳的【具体实施方式】,但本发明的保护范围并不局限于此, 任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,根据本发明的技术方案及其 发明构思加以等同替换或改变,都应涵盖在本发明的保护范围之内。
【主权项】
1. 一种适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片保存液,其特征在于,所述保存 液包括: 十二燒基硫酸纳,按质量/体积比: 1,4%,即l,4g/100mL; 乙醇,按体积/体积比: 5-10%; 氯仿,按体积/体积比: 5-10%; β-硫基乙醇,按体积/体积比: 2%; 错酸钠,pH=4,S_: 100ramo4/L; 乙二胺四乙锻: 50mmol/L; 氣化/纳: 500mmoi/L.: 聚乙烯吡咯烷酮按质量,/体积:比:: 2%,即2g/100mL; 余量为水。2. -种如权利要求1所述的适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片保存液,其 特征在于,所述禾本科植物为狗牙根、结缕草或水稻。3. -种禾本科植物新鲜叶片的保存及基因组DNA的提取方法,其特征在于,包括如下 步骤: (1) 配制含有如下成分的保存液: 十二烷基硫酸钠,按质量/体积比: 1,4%,即1.4g/100mL; 6醇,按体积八本枳比: 5-10%; 氯仿,按体积八本积比: 5-10%; β-?是基乙醇,按体枳/体积比: 2%; 错酸納,ρΗ==4.8: 100nimol/L.; .乙二.胺四乙酸: 50mmol/L: 氯化钠: 500mmol/L; 聚乙烯吡咯烷酮,按质量以本积比: 2%,即2g/100mL; 余量为水; 按照所述保存液中各成分的比例将十二烷基硫酸钠、乙醇、氯仿、醋酸钠、乙二胺四 乙酸、氯化钠用超纯水溶解和混合后,调节pH= 8.0,定容,然后置于灭菌瓶中在121°C、 0·IMpa灭菌 20min; (2) 灭菌后,加入2%的聚乙烯吡咯烷酮,得到混合液,备用; (3) 将禾本科植物新鲜叶片切割为截面不大于0. 5cm2的条块; (4) 使用前,向(2)中的混合液中加入β-巯基乙醇至终浓度为2%,制得保存液; (5) 将所述禾本科植物新鲜叶片条块浸没在(4)中的保存液中,常温保存; (6) 取步骤(5)保存有禾本科植物新鲜叶片条块的保存液在65°C下加热3-5min,再采 用常规SDS法提取基因组DNA。4. 如权利要求3所述的禾本科植物新鲜叶片的保存及基因组DNA的提取方法,其特征 在于,所述禾本科植物为狗牙根、结缕草或水稻。5. 如权利要求1所述的适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片保存液或如权利 要求3所述的适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片的保存方法在禾本科植物新鲜 叶片保存中的应用。6. 如权利要求1所述的适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片保存液或如权利 要求3所述的适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片的保存方法在提取禾本科植物 基因组DNA的应用。
【专利摘要】本发明提供了一种适用于提取禾本科植物基因组DNA的新鲜叶片保存液及其保存方法和应用。本发明提供的保存液及其保存方法简单有效、成本低廉、适用于禾本科植物新鲜叶片的常温保存;本发明提供的保存液用于提取禾本科植物基因组DNA,能获得多糖、多酚、蛋白质等杂质含量低,高质量的DNA。
【IPC分类】C12N15/10, A01N3/00
【公开号】CN105248414
【申请号】CN201510866618
【发明人】黄春琼, 刘国道, 白昌军
【申请人】中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
【公开日】2016年1月20日
【申请日】2015年12月1日