基于重组酶和超保真DNA聚合酶的大载体DNA的定点突变方法与流程

文档序号:21452996发布日期:2020-07-10 17:46阅读:来源:国知局

技术特征:

1.基于重组酶和超保真dna聚合酶的大载体dna的定点突变方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)定点突变引物设计

设计两对引物,其中一对为突变引物即mpf和mpr,这对引物的5'端互补序列长度为12-15bp,互补区可以任意引入单点或多点突变,任意长度的缺失突变,插入突变1-20bp;另一对引物是协助pcr的引物,由于这一对引物的位置可以设置在已知序列区内,是可变动的,可以在突变位点的前面或后面设置,称之为pcr可变引物pcrvf和pcrvr;

(2)聚合酶链式反应设置和产物纯化

(i)以0.5-1ngdna为模板,用phantamax超保真dna聚合酶分别设立两个不同的pcr反应;

(ii)pcr热循环;

(iii)利用axygen胶回收试剂盒按照试剂盒说明书回收纯化以上两种pcr产物,利用琼脂糖凝胶电泳对回收产物进行鉴定;

(3)重组酶连接反应

将上述步骤(2)中子步骤(iii)中纯化的dna按照等摩尔数混合,利用重组酶exnaseii完成连接反应;

(4)转化,质粒提取和测序分析。

2.根据权利要求1所述的基于重组酶和超保真dna聚合酶的大载体dna的定点突变方法,其特征在于,步骤(2)中子步骤(i)两个不同的pcr反应的体系如下:

pcr反应体系i包括:dna模板0.5ng或稀释的dna1μl,引物mpf和引物pcrvr各0.5μl,含phantamax超保真dna聚合酶反应混合物(2x)20μl,双蒸水18.5μl,共40μl;

pcr反应体系ii包括:dna模板0.5ng或稀释的dna1μl,引物pcrvf和引物mpr各0.5μl,含phantamax超保真dna聚合酶反应混合物(2x)20μl,双蒸水18.5μl,共40μl。

3.根据权利要求1所述的基于重组酶和超保真dna聚合酶的大载体dna的定点突变方法,其特征在于,步骤(2)中的子步骤(ii)pcr热循环为:(1)95℃3分钟;(2)95℃1分钟,55℃15秒,72℃1-10分钟,取决于pcrdna产物长度,1kb/30秒,35个循环;(3)72℃5分钟。

4.根据权利要求1所述的基于重组酶和超保真dna聚合酶的大载体dna的定点突变方法,其特征在于,步骤(3)所述的连接反应,为20μl反应体系:pcr产物ixμl,pcr产物iiyμl,5x连接酶缓冲液,exnaseii1μl,加ddh2o至20μl。

5.根据权利要求1所述的基于重组酶和超保真dna聚合酶的大载体dna的定点突变方法,其特征在于,步骤(4)转化,质粒提取和测序分析,具体步骤为:

(i)转化:取细菌感受态细胞30μl置于冰上,加入步骤(3)中的连接产物3μl,冰浴45min;冰浴完成后于42℃水浴锅中热激60sec,置冰上冰浴2min后加入200μlsoc溶液,转至37℃摇床上振荡1h;将转化连接产物的感受态细胞均匀涂在含抗生素的lb固体培养基上并置于37℃恒温箱培养14-16h;

(ii)质粒提取:用接菌环从lb培养皿中挑取单菌落接种于3mllb液体培养基中,转至37℃摇床振荡培养过夜或16h;菌液转入离心管中和在12000rpm速度下离心,收集菌体;利用axygen质粒提取试剂盒按照试剂盒说明书提取质粒;取3μl质粒完成琼脂糖凝胶电泳分析;

(iii)测序分析:取1微克质粒,送测序公司完成dna测序,分析定突变位置的序列是否突变;若每个突变反应完成多个质粒的提取和测序分析,则可分析出此方法完成的每个突变反应的突变效率。


技术总结
本发明提供基于重组酶和超保真DNA聚合酶的大载体DNA的定点突变方法,包括:(1),设计两对引物,其中一对为突变引物即MPF和MPR,这对引物的5'端互补序列长度为12‑15bp,互补区可以任意引入单点或多点突变,任意长度的缺失突变,插入突变1‑20bp;另一对引物是协助PCR的引物,由于这一对引物的位置可以设置在已知序列区内,是可变动的,可以在突变位点的前面或后面设置,称之为PCR可变引物PCRVF和PCRVR;(2)聚合酶链式反应设置和产物纯化;(3)重组酶连接反应;(4)转化,质粒提取和测序分析。本发明可在其互补区域取任意置换碱基,进行任意长度的缺失突变,长片段拆入突变,可以用于大载体DNA定点突变而且表现出很高突变效率。

技术研发人员:邓文生;史开拓
受保护的技术使用者:武汉科技大学
技术研发日:2020.02.25
技术公布日:2020.07.10
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