技术特征:
1.一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的方法,其特征在于,步骤如下:s1、提取待测物种的全基因组dna;s2、利用dna条形码引物进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;s3、电泳检测pcr产物,如果没有目标条带,则判定待测物种不是香花油茶,如果有目标条带,则进行下一步;s4、对所得pcr产物进行测序,得到待测核苷酸序列;将所述待测核苷酸序列与dna条形码的核苷酸序列进行同源性比对,鉴别香花油茶物种,并进行系统发育树分析。2.根据权利要求1所述的一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的方法,其特征在于:dna条形码引物包括matk引物、rbcl引物或trnh-psba引物中的一种或多种。3.根据权利要求2所述的一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的方法,其特征在于,matk的扩增引物为:正向引物5
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tccatgggtttatatggatccttcctggtt-3’;反向引物5
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cccgccatggatggaagaattcaaaagata-3’。4.根据权利要求2所述的一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的方法,其特征在于,rbcl的扩增引物为:正向引物5
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atgtcaccacaaacagagactaaagc-3’反向引物5
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gtaaaatcaagtccaccrcg-3’。5.根据权利要求2所述的一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的方法,其特征在于,trnh-psba的扩增引物为:正向引物5
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cgcgcatggtggattcacaatcc-3’反向引物5
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gttatgcatgaacgtaatgctc-3’。6.根据权利要求1所述的一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的方法,其特征在于,步骤s2中pcr扩增体系为:10μl 2
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pcr扩增体系混合液,10μm引物对,30ng的dna模板,反应体系终体积20μl;pcr反应条件为94℃反应3min;然后94℃变性35s,55℃退火30s,72℃延展1min,如此35个循环;最后72℃延展7min。7.一种基于dna条形码准确鉴定香花油茶的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中含有如权利要求3-5任一项所述的引物对。
技术总结
本发明公开了一种基于DNA条形码准确鉴定香花油茶的方法,步骤如下:S1、提取待测物种的全基因组DNA;S2、利用DNA条形码引物进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;S3、电泳检测PCR产物,如果没有目标条带,则判定待测物种不是香花油茶,如果有目标条带,则进行下一步;S4、对所得PCR产物进行测序,得到待测核苷酸序列;将所述待测核苷酸序列与DNA条形码的核苷酸序列进行同源性比对,鉴别香花油茶物种,并进行系统发育树分析。本发明采用上述的一种基于DNA条形码准确鉴定香花油茶的方法,通过条形码组合在基因组范围内实现阶层条形码,达到物种自动鉴定的目的。定的目的。定的目的。
技术研发人员:张照远 郝丙青 叶航 马锦林 孟中磊 陈国臣 王东雪 蔡娅 吴方圆 戴艳花
受保护的技术使用者:广西壮族自治区林业科学研究院
技术研发日:2022.01.06
技术公布日:2022/3/22