在某些实施例中，设想了作物植物（例如，谷类W及干豆、玉米、小麦、马铃馨、树 馨（tapioca)、水稻、高梁、粟、木馨、大麦、魏豆、W及其他根、块茎、或种子作物）。用于本披 露的重要的种子作物是油巧油菜、甜菜、玉米、向日葵、大豆、W及高梁。在某些实施例中，设 想了园艺植物，包括窝宦、菊宦、W及蔬菜芸苔属（包括卷屯、菜、西建兰W及花挪菜），W及 香石竹、天竺葵、卿趴花、W及秋海棠。本披露可W应用于烟草、瓜类蔬菜、胡萝K草替、向 日葵、番茄、胡椒、菊、杨木、按树、W及松木。在某些实施例中，设想了如谷物种子的植物，如 玉米、小麦、大麦、水稻、高梁、裸麦。在某些实施例中，设想了如油巧植物的植物。油巧植物 包括卡罗拉油菜、棉花、大豆、红花、向日葵、芸苔、玉米、首猜、栋桐、挪子等。在某些实施例 中，设想了如豆科植物的植物。豆科植物包括菜豆和魏豆。豆类包括瓜尔豆、槐豆、胡芦己、 大豆、四季豆、班豆、绿豆、利马豆、蚕豆、滨豆、鹰嘴豆、等等。
[0147]在某些实施例中，植物是单子叶植物和/或双子叶植物。有用的单子叶植物的非 限制性例子是水稻、玉米、小麦、栋桐树、草坪草、大麦、W及燕麦。有用的双子叶植物的非限 制性例子是大豆、棉花、首猜、卡罗拉油菜、亚麻、番茄、甜菜、向日葵、马铃馨、烟草、玉米、小 麦、水稻、窝宦、芹菜、黄瓜、胡萝K花挪菜、葡萄、W及草坪草。在某些实施例中，设想了如 有花植物、树、草、阴生植物、W及开花的和不开花的观赏植物的植物。
[014引可用于本披露的植物有害生物（即，可变得为非致病的或减小病原性）包括真菌、 线虫动物、细菌、W及寄生植物，如独脚金（Striga)、寃丝子W及搬寄生。通过本披露有用地 治疗的植物有害生物包括霜霉菌（downymildews)。
[0149]技术人员可易于鉴定有待祀向的有害生物基因。该种基因可W是在该种有害生物 对宿主植物的有害作用中起着直接或间接作用的任何有害生物基因。仅通过举例的方式， 该种基因可W是在有害生物生长、发育、复制和繁殖、W及侵入或者侵染中起作用的基因。
[0150]在某些实施例中，该有害生物是一种植物病毒。该种植物病毒的例子是大豆花叶 病毒、亞英色斑病毒、烟草环斑病毒、大麦黄矮病毒、小麦主轴条斑病毒、上传花叶病毒、玉 米中的小麦条斑病毒、玉米矮缩花叶病毒、玉米稱绿矮缩病毒、黄瓜花叶病毒、烟草花叶病 毒、首猜花叶病毒、马铃馨X病毒、马铃馨Y病毒、马铃馨卷叶病毒W及番茄金色花叶病毒。 在该些之中，针对玉米矮缩花叶病毒、大麦黄矮病毒、小麦条斑花叶病毒、±传花叶病毒、马 铃馨卷叶病毒W及黄瓜花叶病毒的保护是尤其重要的。
[0151]在某些实施例中，有害生物是草替灰霉病菌炬otrytiscinerea)，一种具有异常 广泛的宿主范围的死体营养型病原性真菌。栽培番茄（主要为Lycopersiconesculentum) 也易受灰霉菌炬otrytis)的感染，并且真菌一般影响番茄植株的茎、叶W及果实。
[0152]表达化s9和祀向核酸复合物的转基因动物
[0153] 除了转基因植物之外，本披露的某些实施例设想了表达在此披露的化s9系统W 防止病原性感染（例如病毒）的转基因动物。所设想的转基因动物的非限制性例子包括鱼、 牲畜和宠物。在某些实施例中，本披露设想了用编码或表达在此披露的化s9系统的期望核 酸转化在组织培养基中生长的胚胎干细胞（ES细胞）。在某些实施例中，本披露设想了将在 此披露的克隆载体注入到人或非人动物的分离的胚胎干细胞中。
[0154] 可通过将胚胎干细胞与编码在此披露的化s9系统的载体在ES细胞将核酸渗入到 该ES细胞的基因组中的条件下混合来在培养基中转化ES细胞。可通过将转化细胞注入到 生物催化剂的内细胞团（ICM)中，接着例如通过使雌性与输精管切除的雄性交配制备假孕 动物来分离和选择成功转化的细胞。交配的刺激引发进行子宫接纳通常所需的激素变化。 可替代地，可利用激素的直接给药。将胚胎植入子宫中为发育具有表达在此披露的化s9系 统的核酸的转基因动物提供条件。
[0155] 作为产生转基因动物的替代方法，可通过将克隆载体注入到精子原核中来转化受 精卵。在融合之后，合子将分裂形成两个胚胎细胞。可W如上所述将胚胎植入假孕代母中。
[0156] 在某些实施例中，本披露设想了包含表达在此披露的化s9系统与另一种蛋白质 的组合（例如，生长激素）的核酸的转基因动物。在此披露的克隆载体可被配置成替代祀 基因。在某些实施例中，本披露设及包含表达在此披露的化s9系统的核酸和在它们的奶中 表达重组蛋白的核酸的转基因绵羊或山羊。
[0157] 在某些实施例中，本披露设想了包含表达在此披露的化s9系统的核酸和在它们 的蛋（例如，蛋白）中表达重组蛋白的核酸的转基因鸡。
[015引基因疗法
[0159] 在某些实施例中，本披露设及治疗或预防疾病、病症、或感染的方法，该些方法包 括向对其有需要的受试者给予有效量的重组载体，该重组载体编码在此披露的化s9和核 酸复合物。
[0160] 在某些实施例中，本披露设及治疗或预防病毒感染或其他病原性感染的方法，该 些方法包括给予有效量的被配置成表达祀向病毒或病原性核酸的化s9-核酸复合物的载 体。
[0161] 在某些实施例中，本披露设想了与其他治疗剂、抗病原剂、抗病毒剂、抗细菌剂或 疫苗结合给药。在某些实施例中，抗病毒剂选自阿己卡韦、阿昔洛韦、阿昔洛韦、阿德福 韦、金刚胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥（atripla)、波普瑞韦、西多 福韦、双汰芝、complera、达芦那韦、地拉韦晚、去哲肌巧、二十二醇、度鲁特韦、依度尿巧 (edoxudine)、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、泛昔洛韦、福米韦生、福沙那韦、麟 甲酸钢、麟己酸钢、更昔洛韦、伊己他滨、伊姆诺韦（imunovir)、舰巧、咪嗟莫特、巧地那韦、 肌巧、III型干扰素、II型干扰素、I型干扰素、拉米夫定、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗咐 脈、美替沙腺、奈非那韦（nelfmavir)、奈韦拉平、奈沙韦（nexavir)、奥司他韦、聚己二醇干 扰素a-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普利康那利（pleconaril)、鬼白毒素、雷特格韦、利己韦 林、金刚己胺、利托那韦、喀晚、沙奎那韦、司他夫定、stribiW、替诺福韦、替诺福韦地索普、 替诺福韦艾拉酪胺富马酸醋（TAF)、替拉那韦、S氣尿巧、S协唯（trizivir)、曲金刚胺、特 鲁瓦达（truvada)、伐昔洛韦、鄉更昔洛韦、韦克利韦洛克（vicriviroc)、阿糖腺巧、韦拉米 晚（viramidine)、扎西他滨、扎那米韦、或齐多夫定、W及其组合。
[0162] 在某些实施例中，本披露设想了通过祀向RNA和DNA病毒，例如，祀向RNA病毒的 基因组和/或转录物或DNA病毒的病毒转录物来治疗和/或预防病毒感染。在一些实施 例中，该病毒为或受试者被诊断患有甲型流感病毒（包括亚型HlNl)，己型流感病毒，丙型 流感病毒，轮状病毒A，轮状病毒B，轮状病毒C，轮状病毒D，轮状病毒E，SARS冠状病毒，人 类腺病毒类型（HAdV-1至55)，人乳头瘤病毒（HPV)类型16、18、31、33、35、39、45、51、52、 56、58、59，细小病毒819，触染性软扼病毒，1(：病毒〇〇0，服病毒，默克尔曲6'1?51)细胞 多瘤病毒，甲型柯萨奇病毒，诺如病毒，风疹病毒，淋己细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV)， 黄热病毒，麻疹病毒，腮腺炎病毒，呼吸道合胞病毒，牛癌病毒，加利福巧亚脑炎病毒，汉坦 病毒，狂犬病病毒，埃博拉病毒，马尔堡病毒，单纯性瘤疹病毒-1 ^sv-i)，单纯性瘤疹病 毒-2 01SV-2)，水痘带状瘤疹病毒（VZV)，邸病毒巧pstein-Barrvirus)巧^)，巨细胞病毒 (CMV)，瘤疹淋己细胞病毒，玫瑰疹病毒（roseolovirus)，卡波氏肉瘤相关瘤疹病毒，甲型肝 炎病毒（HAV)，己型肝炎病毒（皿V)，丙型肝炎病毒（HCV)，了型肝炎病毒（皿V)，戊型肝炎病 毒（肥V)、人类免疫缺陷病毒化IV)，I型人嗜T淋己细胞病毒（HTLV-1)，弗罗德脾脏病灶形 成病毒（SFFV)或异嗜性MuLV相关病毒狂MRV)。
[0163] 在某些实施例中，本披露设想了祀向RNA病毒的RNA基因组中的多个位点，或DNA 病毒的RNA转录物，W用于防止病毒产生抗性的目的。
[0164] 在某些实施例中，本披露设想了可使用化s9和祀向不同病毒的浊NA的混合物作 为一种"一次性（one-shot)"治疗。
[0165] 在某些实施例中，本披露设想了使用在此披露的化s9系统来改善受试者处理并 且对疫苗产生应答的能力，该通过将在此披露的克隆载体与疫苗结合给药来实现，其中 化c9核酸复合物被配置成具有gRNA，W祀向IL-10和/或其他抗炎性细胞因子的mRNA表 达、和/或祀向mRNA表达PD-1/PD-L1。
[0166] 在某些实施例中，本披露设想了使用化s9系统治疗癌症。例如，gRNA可被配置成 祀向在癌细胞中过表达的mRNA或微RNA或控制癌基因的表达。一些癌症遏制RNAi机器， 但是在具有在此披露的化s9系统的情况下，将可能不能该样做。用在此披露的化s9系统 祀向mRNA通常导致基因产物的表达降低，而祀向微RNA通常导致基因产物的表达增加。
[0167] 在某些实施例中，本披露设及治疗或预防癌症，包括给予表达在此披露的化s9和 指导核酸复合物的载体，其中癌症选自脑癌、肺癌、子宫颈癌、卵巢癌、结肠癌、乳腺癌、胃 癌、皮肤癌、卵巢癌、膜腺癌、前列腺癌、颈癌、W及肾癌。
[0168] 在某些实施例中，本披露设及治疗癌症的方法，包括给予有效量的在此披露的克 隆载体，该克隆载体被配置成表达祀向与癌基因相关联的mRNA或微RNA的化s9和指导核 酸复合物。在某些实施例中，祀mRNA或微RNA与W下相关联；K-ras、含有3个的杆状病毒 IAP重复序列、含有7个的杆状病毒IAP重复序列、肿瘤蛋白p53、肿瘤蛋白p53调控的细胞 调亡诱导蛋白1、肿瘤蛋白p73、血管内皮生长因子A、v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因、磯酸酶和 紧张素、B细胞化L/淋己瘤2、信号转导和转录活化蛋白3、表皮生长因子受体、v-erb-b2禽 成红细胞白血病病毒癌基因、肿瘤坏死因子、肿瘤坏死因子超家族成员14、B细胞1中的K 轻多肤基因增强子的核因子、连环蛋白（巧粘蛋白相关蛋白）0 1、转化生长因子0 1、细胞 周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A、半脱天冬酶3、半脱天冬酶8、半脱天冬酶9、端粒酶逆转录 酶、低氧诱导因子1a亚基、ATP结合盒亚家族B、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A、v-myc 禽成髓细胞瘤病毒癌基因、膜岛素样生长因子1、基质金属蛋白酶7、基质金属蛋白酶9、白 细胞介素8、细胞周期蛋白B1、细胞周期蛋白D1、趋化因子（C-C基序）配体2、巧粘蛋白1、 E-巧粘蛋白、促细胞分裂原活化蛋白激酶1、丫干扰素、肿瘤坏死因子（配体）超家族成员 10、微管相关蛋白tau、细胞调亡的X连锁抑制剂、Fas细胞表面死亡受体、成视网膜细胞瘤 l、Bd-2、B化2样2、B化2相关X蛋白、B化2括抗剂/杀手1、小窝蛋白1、小窝蛋白、雷帕霉 素的机制祀标、v-kit哈迪-朱克曼（Hardy-Zuckerman)4猫科肉瘤病毒癌基因、促细胞分裂 原活化的蛋白激酶14、腺瘤性结肠息肉蛋白、极光激酶B、细胞周期蛋白依赖性激酶1、细胞 周期蛋白依赖性激酶4、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B、血红素加氧酶（脱环）Unotch Unotch2、分泌型磯蛋白1、促细胞分裂原活化的蛋白激酶3、矮小相关转录因子1、叉头框 03、叉头框P3、jun原癌基因、多腺巧二磯酸核糖聚合酶1、哈维化arvey)大鼠肉瘤病毒癌基 因、糖原合酶激酶3 0、氧化氮合酶2、ras相关C3肉毒杆菌毒素底物1、E1A结合蛋白p300、 Fas配体、ATP结合盒G2、CR邸结合蛋白、蛋白激酶Ca、fms相关酪氨酸激酶3、成纤维细胞 生长因子2、0-6-甲基鸟嚷岭-DNA甲基转移酶、关卡激酶2、di油1〇IAP-结合线粒体蛋白、 帕金森蛋白2、polo样激酶1、转录因子7样2、E2F转录因子1、高迁移率族厘1、早幼粒细 胞性白血病、BCL2样1、尿激酶纤溶酶原活化蛋白、肿瘤坏死因子受体超家族成员1A、增殖 细胞核抗原、尿激酶受体纤溶酶原活化蛋白、APEX核酸酶、凝集素半乳糖巧结合可溶物3、 骨髓细胞白血病序列1、大麻素受体1、缝隙连接蛋白a1、由单克隆抗体Ki-67识别的抗原、 巧感应受体、血小板反应蛋白l、P〇U种类5同源异型框1、肝细胞核因子4a、转化生长因子 0受体II、血小板衍生的生长因子受体a多肤、runt相关转录因子2、血管内皮生长因子 C、早期生长应答1、血管生成素2、BMI1多梳环指癌基因、帕金森蛋白7、v-myc禽成髓细胞 瘤病毒癌基因成神经细胞瘤、v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同系物2、肥A组蛋白家族成员X、 结节性硬化2、输出蛋白1、肤酷脯氨酷顺/反异构酶NIM-相互作用UdickkopfWNT信号 传导途径抑制剂Ubeclin1、血小板衍生的生长因子0多肤、肌动蛋白结合蛋白、融合在 肉瘤中的集落刺激因子2、ets变体6、GATA结合蛋白1、RAN成员RAS致癌基因、Kru卵el样 因子4、Kru卵el样因子5、淋己样增强子-结合因子1、组蛋白脱己酷酶6、释蛋白1、叶酸盐 水解酶1、RASp21蛋白活化蛋白1、富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子1、磯脂酷肌醇蛋白聚 糖3、细胞粘附分子1、无翼型MMTV整合位点家族成员1、血小板衍生的生长因子a多肤、连 接桥粒斑珠蛋白、蛋白精氨酸甲基转移酶1、白细胞介素11、成视网膜细胞瘤样2、E2F转录 因子3、肿瘤相关巧信号转导物2、XIAP相关因子1、微管相关蛋白4、长寿蛋白6、韦母氏肿 瘤1相关蛋白、或其组合。
[0169] 在某些实施例中，本披露设及治疗癌症的方法，该些方法包括向对其有需要的受 试者给予有效量的在此披露的克隆载体，该克隆载体被配置成表达祀向与生长因子或促细 胞分裂原（例如c-Sis)相关的mRNA或微RNA的化s9和指导核酸复合物。在某些实施例中， 该癌症选自或该受试者被诊断患有成胶质细胞瘤、纤维肉瘤、骨肉瘤、乳腺癌、或黑素瘤。
[0170] 在某些实施例中，本披露设及治疗癌症的方法，该些方法包括向对其有需要的受 试者给予有效量的在此披露的克隆载体，该克隆载体被配置成表达祀向与受体酪氨酸激酶 (例如，表皮生长因子受体巧GFR)、血小板衍生的生长因子受体（PDGFR)、W及血管内皮生 长因子受体（VEGFR)、肥R2/neu)相关的mRNA或微RNA的化s9和指导核酸复合物。在某些 实施例中，该癌症选自或该受试者被诊断患有乳腺癌、胃肠道基质肿瘤、非小细胞肺癌、或 膜腺癌。
[0171] 在某些实施例中，本披露设及治疗癌症的方法，该些方法包括向对其有需要的受 试者给予有效量的在此披露的克隆载体，该克隆载体被配置成表达祀向与胞质酪氨酸激酶 (例如，酪氨酸激酶的Src-家族、Syk-ZAP-70家族、W及BTK家族）相关的mRNA或微RNA 的化s9和指导核酸复合物。在某些实施例中，该癌症选自或该受试者被诊断患有结肠直肠 癌、乳腺癌、黑素瘤、卵巢癌、胃癌、头颈癌、膜腺癌、肺癌、脑癌、或血癌。
[0172] 在某些实施例中，本披露设及治疗癌症的方法，该些方法包括向对其有需要的受 试者给予有效量的在此披露的克隆载体，该克隆载体被配置成表达祀向与胞质丝氨酸/苏 氨酸激酶及其调控亚基（例如，Raf激酶和细胞周期蛋白依赖性激酶）相关的mRNA或微RNA 的化s9和指导核酸复合物。在某些实施例中，该癌症选自或该受试者被诊断患有恶性黑素 瘤、乳头状甲状腺癌、结肠直肠癌、或卵巢癌。
[0173] 在某些实施例中，本披露设及治疗癌症的方法，该些方法包括向对其有需要的受 试者给予有效量的