一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒污染菌的快速检测方法_2

文档序号:9411655阅读:来源:国知局
1. 5ml离心管中,13, 000Xg离心2min,收集细 胞沉淀,移去上清液;加入480ul 50mM EDTA彻底重悬细胞;加入120ul的10mg/ml溶酶 菌,37°C孵育60min,13, 000Xg离心2min,移去上清液。之后按照Qiagen公司GenomicDNA Purification Kit试剂盒的使用说明提取啤酒污染菌的DNA模板;
[0046] (2)三重PCR扩增
[0047] 将多重PCR扩增反应体系振荡混匀后,进行多重PCR扩增,得到扩增产物;
[0048] 多重PCR反应体系使用Thermo-DNA Polymerase DNA试剂盒,使用3重PCR反应 体系,所用引物体系为表1所述的SEQ ID N0. 1-6,所述的多重PCR扩增反应体系为100nM 正向混合引物2ul,100nM反向混合引物2ul,25mM的MgC124ul,5XPCR缓冲液4ul,5U/ul 的Taq聚合酶0. 7ul,DNA模板lul,补足双蒸水使总体积为20ul;
[0049] 所述的多重PCR扩增反应的条件是95°C预变性lOmin ;以94°C 30s,58°C 30s, 70°Clmin为1个循环,共进行35个循环;4°C保温;
[0050] (3)毛细管电泳分离条件
[0051] 分离体系由lul上述多重PCR扩增产物与95%去离子甲酰胺38. 5ul,400bpDNA MarkerO.5ul混合均勾构成;
[0052] 分尚条件:在50°C、6. 0KV电压下,分尚35min;
[0053] (4)数据分析
[0054] 使用贝克曼库尔特的GenomeLabGeXP Genetic Analysis System分析系统自动 对分离结果进行分析,得到多重PCR-毛细管电泳谱图,结果如图2所示,检测出巨型球菌 (Megasphaera)、果胶杆菌(Pectinatus)和乳酸片球菌(Pediococcus) 16s rRNA 基因的特 征峰,说明样品中含有具有啤酒污染能力的啤酒污染菌,且与对照培养实验结果相吻合。
[0055] 实施例3 :
[0056]乳酸菌(Lactobacillus)是啤酒中另一种常见污染菌。本实例可以证明本发明对 巨型球菌(Megasphaera)、果胶杆菌(Pectinatus)和乳酸片球菌(Pediococcus)的检测特 异性,即本发明的检测方法在仅乳酸菌(Lactobacillus)存在情况下,未显示特征峰,乳酸 菌(Lactobacillus)存在不会对检测产生干扰。
[0057] 本实例米用常见污染菌短乳杆菌Lactobacillus brevis、干酪乳杆菌 Lactobacillus casei、乳酉爱杆菌Lactobacillus coryniformi、植物乳杆菌Lactobacillus plantarum作为干扰菌。
[0058] 本发明的操作步骤如实施例1或2所述。
[0059] (1)啤酒污染菌的培养及DNA模板提取:
[0060] 分别挑取平板培养基上长出的短乳杆菌Lactobacillus brevis、干酪乳杆菌 Lactobacillus casei、乳酉爱杆菌Lactobacillus coryniformi、植物乳杆菌Lactobacillus plantarum单菌落加入10mL成品酒液中,混勾,制成菌悬液;取lmL该菌悬液加入1. 5ml离 心管中,13,000\8离心21^11,收集细胞沉淀,移去上清液;加入480111的501111^0了4彻底重 悬细胞;加入120ul的10mg/ml溶酶菌,37°C孵育60min,13, 000Xg离心2min,移去上清液。 之后按照Qiagen公司的Genomic DNA Purification Kit试剂盒的使用说明提取啤酒污染 菌的DNA模板,并使用紫外分光光度计在260nm波长条件下测定提取的DNA质量,将DNA溶 液稀释至250ng/ul,-20°C保存备用。
[0061] (2)三重PCR扩增
[0062] 将多重PCR扩增反应体系振荡混匀后,进行多重PCR扩增,得到扩增产物;
[0063] 所用引物体系为表1所述的SEQ ID NO. 1~6,所述的多重PCR扩增反应体系为 100nM正向混合引物2ul,100nM反向混合引物2ul,25mM的MgCl24ul,5 X PCRBuf f er4ul,5U/ ul的Taq聚合酶0. 7ul,DNA模板lul,补足双蒸水使总体积为20ul;
[0064] 所述的多重PCR扩增反应的条件是95°C预变性10min ;以94°C 30s,58°C 30s, 70°C lmin为1个循环,共进行35个循环;4°C保温;
[0065] (3)毛细管电泳分离条件
[0066] 分离体系:lul所述步骤(2)中所得的扩增产物与95%去离子甲酰胺38. 5ul, 400bpDNA MarkerO.5ul混合均勾;
[0067] 分尚条件:在50°C、6. 0KV电压下,分尚35min ;
[0068] (4)数据分析
[0069] 使用贝克曼库尔特的GenomeLabGeXP Genetic Analysis System分析系统自动对 分离结果进行分析,结果显示,没有特征峰出现,即乳酸菌(Lactobacillus)的存在对检测 结果没有影响,不会出现假阳性结果。
[0070] 序列表
[0071]
【主权项】
1. 一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒污染菌的快速检测方法, 其特征在于该方法包括以下步骤: 步骤(1)、啤酒污染菌的培养及DNA模板提取: 将检测啤酒样品在厌氧环境中静置过夜富集培养,过滤收集细胞沉淀;然后在细胞沉 淀中依次加入 50mM EDTA 480ul、10mg/ml 溶菌酶 120ul,37°C孵育 60min,13, OOOXg 离心 2min,移去上清液;最后米用试剂盒提取啤酒污染菌的DNA模板; 步骤(2)、多重PCR扩增: 将多重PCR扩增反应体系振荡混匀后,进行多重PCR扩增,得到扩增产物; 所述的多重PCR扩增反应体系为20ul由IOOnM正向混合引物2ul,IOOnM反向混合引 物 2ul,25mM 的 MgCl24ul,5 X PCRBuf f er 4ul,5U/ul 的 Taq 聚合酶 0? 7ul,DNA 模板 Iul,余 量的双蒸水组成;其中正向混合引物为SEQ ID NO. 1、3、5的混合引物,反向混合引物为SEQ ID NO. 2、4、6的混合引物; 步骤(3)、对含有上述扩增产物的分离体系进行毛细管电泳分离; 步骤(4)、检测鉴定:所述步骤(2)中所得的扩增产物经过毛细管电泳分离时,通过 多重基因表达遗传分析系统自动检索、收集样品中荧光信号,判断是否在基因片段长度为 161bp、181bp、176bp相应位置处出现特征峰;若在161bp相应位置处出现特征峰,则判断为 该检测样品中含有巨型球菌;若在ISlbp相应位置处出现特征峰,则判断为该检测样品中 含有果胶杆菌;若在176bp相应位置处出现特征峰,则判断为该检测样品中含有乳酸片球 菌。2. 如权利要求1所述的一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒污 染菌的快速检测方法,其特征在于步骤(2)所述的多重PCR扩增反应体系中正向混合引物 中SEQ ID NO. 1引物、SEQ ID NO. 3引物、SEQ ID NO. 5引物的浓度比为1:1:1,反向混合引 物中SEQ ID NO. 2引物、SEQ ID NO. 4引物、SEQ ID NO. 6引物的浓度比为1:1:1。3. 如权利要求1所述的一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒污 染菌的快速检测方法,其特征在于步骤(2)所述的多重PCR扩增反应的条件是95°C预变性 IOmin ;以94°C变性30s ;58°C退火30s ;70°C延伸Imin为1个循环,共进行35个循环;4°C 保温。4. 如权利要求1所述的一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒污 染菌的快速检测方法,其特征在于步骤(3)所述的毛细管电泳分离体系包括Iul步骤(2) 所得的扩增产物、体积含量为95%的去离子甲酰胺38. 5ul、400bp DNA Marker 0. 5ul。5. 如权利要求1所述的一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒 污染菌的快速检测方法,其特征在于步骤(3)所述的毛细管电泳分离条件如下:在50°C、 6. OKV电压下,分离35min。
【专利摘要】本发明公开一种能同时鉴定巨型球菌、果胶杆菌、乳酸片球菌三种啤酒污染菌的快速检测方法。该方法包括啤酒污染菌的培养及DNA模板提取,然后通过采用高通量的多重PCR技术与高分辨率的毛细管电泳分离技术相结合的方式,从而实现对啤酒生产过程快速确定啤酒中是否存在污染菌的检测。本发明相对于目前其他以PCR技术为基础的分子生物学检测手段,能够在一次反应中集成检测3种抗酒花基因极度厌氧菌,节约了检测成本,节省了检测时间,检测时间由原7~14天缩短到8h。
【IPC分类】C12Q1/04, C12R1/01, C12Q1/68
【公开号】CN105132561
【申请号】CN201510582957
【发明人】沈洁
【申请人】杭州电子科技大学
【公开日】2015年12月9日
【申请日】2015年9月14日
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