1.分离基因组DNA片段的方法,包括:
提供含有具有高分子量(HMW)DNA的颗粒的样品;
将样品截留在凝胶基质中;
将具有截留的样品的凝胶基质暴露于裂解试剂,所述裂解试剂配置为从颗粒中释放HMW DNA;
通过以下纯化样品的HMW DNA:使凝胶基质经受电泳场,所述电泳场配置为从颗粒除去HMW DNA,从凝胶基质除去裂解试剂和/或其他样品成分,从而保留HMW DNA;
使所述凝胶基质经受DNA裂解酶试剂,所述DNA裂解酶试剂配置为在HMW DNA内的特定DNA序列处进行裂解,以便将DNA的确定的区段释放为尺寸减小的片段;
使凝胶基质经受电泳场,所述场被配置为:移动并由此将DNA片段与保持基本不动的HMW DNA的未裂解DNA分离;和
从凝胶基质分离电泳分离的DNA片段。
2.根据权利要求1所述的方法,其中HMW DNA的未裂解的剩余部分保持截留在所述凝胶基质中。
3.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述颗粒包含在液体悬浮液中并且包含选自由以下组成的组的至少一种完整细胞:动物,植物,细菌,真菌,古细菌,原生动物,和完整病毒颗粒。
4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述凝胶基质包含浓度为约0.2%至约5%(重量/体积)的琼脂糖水凝胶。
5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述裂解剂包含浓度为0.05%至10%的阴离子去污剂。
6.如权利要求5所述的方法,其中所述阴离子去污剂是十二烷基硫酸钠(SDS)。
7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述HMW DNA的尺寸是长度>10兆碱基对,并且所述DNA片段的尺寸是长度<2兆碱基对。
8.根据权利要求3所述的方法,其中在包含细菌,植物或真菌细胞的颗粒的情况下,所述方法进一步包括使所述凝胶基质经受配置成在裂解之前除去细胞壁的其他酶试剂处理。
9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中通过电洗脱将所述DNA片段从所述凝胶基质中分离到含有液体缓冲液的洗脱模块中。
10.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中DNA裂解酶试剂包含一种或多种RNA指导的内切核酸酶组合物。
11.根据权利要求11所述的方法,其中所述RNA指导的内切核酸酶组合物基于Cas9蛋白,其中指导RNA被配置以使所述指导RNA-Cas9复合物在所述HMW DNA的特定用户指定位点处裂解。
12.分离基因组DNA片段的方法,包括:
提供含有高分子量(HMW)DNA的样品;
将样品截留在凝胶基质中;
使凝胶基质经受DNA裂解酶试剂,所述DNA裂解酶试剂配置为在HMW DNA内的特定DNA序列处进行裂解,以便将HMW DNA的确定的区段释放为尺寸减小的片段;
使凝胶基质经受电泳场,所述场被配置为:移动并由此将DNA片段与保持基本不动的HMW DNA的未裂解DNA分离;和
从凝胶基质中分离电泳分离的DNA片段。
13.分离基因组DNA片段的方法,包括:
将高分子量(HMW)DNA截留在凝胶基质中;
使凝胶基质经受DNA裂解酶试剂,所述DNA裂解酶试剂配置为在HMW DNA内的特定DNA序列处进行裂解,以便将HMW DNA的确定的区段释放为尺寸减小的片段;
使凝胶基质经受电泳场,所述场被配置为:移动并由此将DNA片段与保持基本不动的HMW DNA的未裂解DNA分离;和
从凝胶基质中分离电泳分离的DNA片段。
14.一种用于执行根据权利要求1-13中任一项所述的方法的装置或系统。