1.抗体,其包含至少一个能够结合5t4(滋养层糖蛋白)的抗原结合区,其中所述抗体能够阻断包含重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区的抗体[059]与5t4的结合,所述重链可变(vh)区包含以seqidno:5所示的序列,所述轻链可变(vl)区包含以seqidno:9所示的序列。
2.权利要求1的抗体,其中所述抗体阻断选自下组的抗体与5t4的结合:
a)抗体,其含有包含以seqidno:40所示的序列的重链可变(vh)区和包含以seqidno:44所示的序列的轻链可变(vl)区[207],
b)抗体,其含有包含以seqidno:47所示的序列的重链可变(vh)区和包含以seqidno:51所示的序列的轻链可变(vl)区[226];和
c)抗体,其含有包含以seqidno:5所示的序列的重链可变(vh)区和包含以seqidno:9所示的序列的轻链可变(vl)区[059]。
3.权利要求1或2的抗体,其中所述抗体阻断选自下组的抗体与5t4的结合:
a)抗体,其含有包含以seqidno:40所示的序列的重链可变(vh)区和包含以seqidno:44所示的序列的轻链可变(vl)区[207];和
b)抗体,其含有包含以seqidno:47所示的序列的重链可变(vh)区和包含以seqidno:51所示的序列的轻链可变(vl)区[226]。
4.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中5t4是人(智人)5t4,如seqidno:1的成熟多肽序列。
5.根据权利要求1至3中任一项的抗体,其中5t4是食蟹猴(成束猴)5t4,如seqidno:2的成熟多肽序列。
6.根据权利要求1-3中任一项的抗体,其中5t4是鸡(原鸡)5t4,如seqidno:3的成熟多肽序列。
7.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中5t4是人5t4,如seqidno:1的成熟多肽,和食蟹猴5t4,如seqidno:2的成熟多肽。
8.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中5t4是人5t4,如seqidno:1的成熟多肽序列,食蟹猴5t4,如seqidno:2的成熟多肽序列,和鸡5t4,如seqidno:3的成熟多肽序列。
9.根据前述权利要求中任一项的抗体,所述抗体能够以对应于kd值1e-7m或更小,如5e-8m或更小,1e-8m或更小,5e-9m或更小或如1e-9m或更小的结合亲和力,如以对应于1e-7至5e-10m的范围内,如1e-7至1e-9m,如5e-8至5e-10m,5e-8至1e-9m,如1e-8至5e-10m,1e-8至1e-9m或如1e-8至5e-9m范围内的kd值的结合亲和力结合人5t4、食蟹猴和/或鸡5t4。
10.根据权利要求9的抗体,其中所述结合亲和力通过生物层干扰测量法测定,任选地如本文实施例2所述。
11.根据权利要求9和10中任一项的抗体,其中所述结合亲和力是使用生物层干扰测量法测定的,所述生物层干扰测量法包括以下步骤:
i)将1μg/ml量的抗体在抗人iggfc捕捉生物传感器上固定化600秒;
ii)使用范围为100nm至1.56nm的2倍稀释系列,测定5t4ecdhis(seqidno:99的成熟蛋白)或食蟹猴5t4(seqidno:2的成熟蛋白)或重组食蟹猴5t4蛋白(cusabio;目录号csb-mp024093mov)在200秒的时间段内的缔合和1000秒的时间段内的解离,
iii)相对于缓冲液对照(0nm)参考数据。
12.根据权利要求9-11中任一项的抗体,其中所述结合亲和力是使用如前述权利要求中任一项所定义的抗体测定的,所述抗体是单特异性二价抗体,如作为全长igg1的抗体。
13.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体识别5t4上的表位或抗体结合区或结合位点,所述抗体结合区、结合位点或表位被选自下组的任一种抗体识别:
a)抗体,其含有包含以seqidno:5所示的序列的vh区和包含以seqidno:9所示的序列的vl区[059],
b)抗体,其含有包含以seqidno:12所示的序列的vh区和包含以seqidno:16所示的序列的vl区[076],
c)抗体,其含有包含以seqidno:19所示的序列的vh区和包含以seqidno:23所示的序列的vl区[085],
d)抗体,其含有包含以seqidno:26所示的序列的vh区和包含以seqidno:30所示的序列的vl区[106],
e)抗体,其含有包含以seqidno:33所示的序列的vh区和包含以seqidno:37所示的序列的vl区[127],
f)抗体,其含有包含以seqidno:40所示的序列的vh区和包含以seqidno:44所示的序列的vl区[207];和
g)抗体,其含有包含以seqidno:47所示的序列的vh区和包含以seqidno:51所示的序列的vl区[226]。
14.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4上的抗体结合区、结合位点或表位,其不是被选自下组的抗体结合的抗体结合区或结合位点或表位或不同于被选自下组的抗体结合的抗体结合区、结合位点或表位:
a)抗体,其含有包含以seqidno:87所示的序列的vh区和包含以seqidno:88所示的序列的vl区[h8],
b)抗体,其含有包含以seqidno:83所示的序列的vh区和包含以seqidno:84所示的序列的vl区[a1];和
c)抗体,其含有包含以seqidno:85所示的序列的vh区和包含以seqidno:86所示的序列的vl区[a3]。
15.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体与5t4的结合被包含重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区的抗体[a3]与5t4的结合阻断,所述重链可变(vh)区包含以seqidno:85所示的序列,所述轻链可变(vl)区包含以seqidno:86所示的序列。
16.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体显示与5t4ecdhis(seqidno:99的成熟蛋白)结合的抗体的置换,所述结合5t4的抗体含有包含以seqidno:85所示的序列重链可变(vh)区和包含以seqidno:86所示的序列的轻链可变(vl)区[a3]。
17.根据权利要求14或15的抗体,其中交叉阻断或如前述权利要求中任一项所定义的抗体阻断另一种抗体结合5t4的能力通过荧光激活细胞分选(facs)测定法来测定,例如如实施例5中描述的那样进行的测定法。
18.根据权利要求14至16中任一项的抗体,其中将交叉阻断或如前述权利要求中任一项所定义的抗体阻断另一种抗体结合5t4的能力测定为未缀合的抗体阻断缀合的抗体的结合的能力,并且任选地在包括以下步骤的程序中测定:
i)提供一组样品,每个样品包含人卵巢腺癌sk-ov-3细胞、结合5t4并与异硫氰酸荧光素(fitc)缀合的抗体和过量的靶向5t4的未缀合抗体的混合物,
ii)将所述样品在4℃下温育30分钟,然后对所述样品离心,
iii)从每个样品去除上清液,并将所述细胞重悬于缓冲液中,并使用流式细胞仪测定fitc的平均荧光强度(mfi);并且
iv)如下计算结合百分比:
用与缀合有fitc的抗体和未缀合的抗体的混合物温育的细胞,和未与缀合有fitc的抗体或未缀合的抗体温育的细胞之间的mfi的差乘以100,然后除以与缀合有fitc的抗体和igg-b12抗体的混合物温育的细胞,和未与缀合有fitc的抗体或未缀合的抗体温育的细胞之间的mfi的差。
19.根据权利要求14至17中任一项的抗体,其中所述抗体阻断另一种抗体与5t4的结合或置换与5t4ecdhis(seqidno:99的成熟蛋白)结合的另一种抗体的能力使用生物层干扰测量法测定,例如在如实施例3中描述的测定法。
20.根据权利要求14至18中任一项的抗体,其中在包括以下步骤的程序中使用生物层干扰测量法测定所述抗体阻断另一种抗体结合5t4或置换结合5t4的另一种抗体的能力:
i)将根据前述权利要求中任一项的抗体以10mm乙酸钠缓冲液中的20μg/ml量固定化到活化的胺反应性第二代生物传感器,
ii)在ph8.5的乙醇胺中淬灭具有固定化的抗体的所述生物传感器,
iii)将具有固定化抗体的所述生物传感器浸入包含3.6μg/ml(100nm)人5t4ecdhis(seqidno:99的成熟蛋白)的组合物中达500秒的时间段,然后
iv)将具有固定化抗体和5t4ecdhis的所述生物传感器浸入包含10μg/ml靶向5t4的其他抗体的组合物中,并在500秒的时间段内测定缔合响应;
其中在30℃的温度并以1000rpm摇动的情况下进行步骤i)-iv)。
21.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体结合人5t4上的包含氨基酸残基r73、y92和r94的表位或抗体结合区;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
22.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体结合人5t4上的包含氨基酸残基s69、r73、y92和r94的表位或抗体结合区;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
23.根据权利要求1-21中任一项的抗体,其中所述抗体结合人5t4上的包含氨基酸残基r73、t74、y92、r94和n95的表位或抗体结合区;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
24.根据权利要求21至23中任一项的抗体,其中所述氨基酸残基直接参与所述抗体的结合。
25.根据权利要求21至24中任一项的抗体,其中以下一个或多个另外的氨基酸残基涉及所述抗体的结合,如间接地参与结合,例如通过影响直接参与所述抗体的结合的一个或多个氨基酸残基的蛋白质折叠和/或定位:l89、f111、l117、f138、l144、d148、n152;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
26.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体结合人5t4上的表位或抗体结合区,在所述表位或抗体结合区中氨基酸残基r73、y92和r94直接参与结合所述抗体,并且其中氨基酸残基f111、f138、l144和d148中的一个或多个间接参与所述结合;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
27.根据权利要求1至25中任一项的抗体,其中所述抗体结合人5t4上的表位或抗体结合区,在所述表位或抗体结合区中氨基酸残基s69、r73、y92和r94直接参与结合所述抗体,并且其中氨基酸残基f111、f138和d148中的一个或多个间接参与所述结合;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
28.根据权利要求1至25中任一项的抗体,其中所述抗体结合人5t4上的表位或抗体结合区,在所述表位或抗体结合区中氨基酸残基r73、t74、y92、r94和n95直接参与结合所述抗体,并且其中氨基酸残基f138间接参与所述结合;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
29.根据权利要求21至28中任一项的抗体,其中通过对具有seqidno:1所示的氨基酸序列或seqidno:1的成熟多肽序列的人5t4的丙氨酸扫描来鉴定由所述表位或抗体结合区包含的所述氨基酸残基以及任选地所述一个或多个另外的氨基酸残基。
30.根据权利要求29的抗体,其中如本文实施例16所述或基本上如本文实施例16所述进行所述丙氨酸扫描。
31.根据权利要求29至30的抗体,其中通过包括以下步骤的程序进行所述丙氨酸扫描:
i)在人胚胎肾细胞,例如hek293细胞中个别地表达突变体人5t4多肽和野生型5t4多肽(seqidno:1的氨基酸残基32-355),以便为每个突变体或野生型5t4提供包含70-90.000个细胞,如80.000个细胞的样品,在所述突变体人5t4多肽中除半胱氨酸和丙氨酸外人5t4胞外域中的所有氨基酸残基(对应于seqidno:1的氨基酸残基32-355)个别地用丙氨酸取代,
ii)在室温将每个样品中的所述细胞与20μl所述抗体温育40分钟,所述抗体与缀合有异硫氰酸荧光素(fitc)的抗体(3μg/ml;在facs缓冲液中)缀合,然后在150-180μlfacs缓冲液(磷酸盐缓冲液+0.1%[w/v]bsa+0.02%[w/v]叠氮化钠)洗涤每个样品两次,并且将每个样品中的所述细胞重悬于30μlfacs缓冲液中,
iii)对于每个样品,以所述样品中活的单细胞群体的荧光强度的几何平均值(gmfi)测定每个细胞结合的抗体的平均量,并且使用以下等式,相对于非交叉阻断5t4特异性对照抗体的结合强度标准化每种测试抗体的数据:
其中“aa位置”是指突变为丙氨酸的位置,
其中根据以下计算,计算z得分以表达所述抗体结合的丧失或获得:
其中μ和σ分别是从所有突变体计算的标准化gmfi的平均值和标准差,
其中若特定5t4突变体的所述对照抗体的gmfi低于平均gmfi对照抗体-2.5x平均gmfi对照抗体的sd(来自所有突变体),则从分析中排除数据;以及任选地
其中若残基以正好低于-1.5(例如-1.5至-1.8之间,如-1.5至-1.7之间或如-1.5至-1.6之间)的z得分结合,并且该残基预测为被掩埋并且与大多数残基在空间上分离,则从分析中排除数据,所述大多数残基预测为表面暴露的并且针对所述大多数残基确定结合的丧失或降低的结合。
32.根据权利要求31的抗体,其中步骤iv)中的非交叉阻断5t4特异性对照抗体是双特异性抗体,其包含
-抗原结合区,其包含以seqidno:83所示的vh序列和以seqidno:84所示的vl序列[a1];和
-抗原结合区,其包含以seqidno:97所示的vh序列和以seqidno:98所示的vl序列[b12]。
33.根据权利要求1至20中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基r73、y92和r94中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
34.根据权利要求1至20和33中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基s69、r73、y92和r94中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
35.根据权利要求1至20和33中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基r73、t74、y92、r94和n95中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
36.根据权利要求1至20和33至35中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基l89、f111、l117、f138、l144、d148、n152中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
37.根据权利要求1至20和33至36中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基r73、y92、r94、f111、f138、l144和d148中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
38.根据权利要求1至20和33至36中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基s69、r73、y92、r94、f111、f138和d148中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
39.根据权利要求1至20和33至36中任一项的抗体,其中所述抗体结合5t4,使得若氨基酸残基r73、t74、y92、r94、n95和f138中的任何一个或多个被丙氨酸取代,则存在有结合丧失或结合是减少的;每个氨基酸残基的编号指其在seqidno:1中的位置。
40.根据权利要求33至39中任一项的抗体,其中通过包含seqidno:1的氨基酸残基32-355的多肽的丙氨酸扫描测定丙氨酸取代的效果。
41.根据权利要求33至39中任一项的抗体,其中通过如本文实施例16中所述或基本上如本文实施例16中所述的程序测定丙氨酸取代的效果。
42.根据权利要求33至39中任一项的抗体,其中结合的丧失定义为结合的z得分低于1.5;所述z得分任选地如本文实施例16所述或基本上如本文实施例16所述计算。
43.根据权利要求42的抗体,其中通过包括以下步骤的程序测定丙氨酸取代的效果:
i)在人胚胎肾细胞,例如hek293细胞中个别地表达突变体人5t4多肽和野生型5t4多肽,以便为每个突变体或野生型5t4提供包含70-90.000个细胞,如80.000个细胞的样品,在所述突变体人5t4多肽中除半胱氨酸和丙氨酸外人5t4胞外域中的所有氨基酸残基(对应于seqidno:1的氨基酸残基32-355)个别地用丙氨酸取代,
ii)在室温将每个样品中的所述细胞与20μl所述抗体温育40分钟,所述抗体与缀合有异硫氰酸荧光素(fitc)的抗体(3μg/ml;在facs缓冲液中)缀合,然后在150-180μlfacs缓冲液(磷酸盐缓冲液+0.1%[w/v]bsa+0.02%[w/v]叠氮化钠)洗涤每个样品两次,并且将每个样品中的所述细胞重悬于30μlfacs缓冲液中,
iii)对于每个样品,以所述样品中活的单细胞群体的荧光强度的几何平均值(gmfi)测定每个细胞结合的抗体的平均量,并且使用以下等式,相对于非交叉阻断5t4特异性对照抗体的结合强度标准化每种测试抗体的数据:
其中“aa位置”是指突变为丙氨酸的位置,
其中根据以下计算,计算z得分以表达所述抗体结合的丧失或获得:
其中μ和σ分别是从所有突变体计算的标准化gmfi的平均值和标准差,
其中若特定5t4突变体的所述对照抗体的gmfi低于平均gmfi对照抗体-2.5x平均gmfi对照抗体的sd(来自所有突变体),则从分析中排除数据;以及任选地
其中若残基以正好低于-1.5(例如-1.5至-1.8之间,如-1.5至-1.7之间或如-1.5至-1.6之间)的z得分结合,并且该残基预测为被掩埋并且与大多数残基在空间上分离,则从分析中排除数据,所述大多数残基预测为表面暴露的并且针对所述大多数残基确定结合的丧失或降低的结合。
44.根据权利要求43的抗体,其中步骤iii)中的非交叉阻断5t4特异性对照抗体是双特异性抗体,其包含
-抗原结合区,其包含以seqidno:83所示的vh序列和以seqidno:84所示的vl序列[a1];和
-抗原结合区,其包含以seqidno:97所示的vh序列和以seqidno:98所示的vl序列[b12]。
45.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中与含有包含以seqidno:87所示的序列的重链可变(vh)区和包含以seqidno:88所示的序列的轻链可变(vl)区的抗体[h8]相比,所述抗体具有降低的内在化能力,如通过当与细胞毒性部分缀合时降低的细胞毒性显示。
46.根据权利要求45的抗体,其中使用如实施例7中所述的程序,例如在包括以下步骤的程序中测定细胞毒性:
i)提供一价抗体,其包含如前述权利要求中任一项所定义的抗体的第一fab臂,和能够与hiv病毒蛋白gp120(hiv-1gp120)结合并与duostatin-3缀合的第二fab臂,
ii)在37℃使乳腺癌细胞mda-mb-468(atcc克隆htb-132)或hcc1954(atcc克隆crl-1338)与所述单价抗体接触5天;并且
iii)测定所述细胞的存活力。
47.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区:
a)重链可变(vh)区,其包含seqidno:6、7和8的cdr1、cdr2和cdr3序列[059],
b)重链可变(vh)区,其包含seqidno:13、14和15的cdr1、cdr2和cdr3序列[076],
c)重链可变(vh)区,其包含seqidno:20、21和22的cdr1、cdr2和cdr3序列[085],
d)重链可变(vh)区,其包含seqidno:27、28和29的cdr1、cdr2和cdr3序列[106],
e)重链可变(vh)区,其包含seqidno:34、35和36的cdr1、cdr2和cdr3序列[127],
f)重链可变(vh)区,其包含seqidno:41、42和43的cdr1、cdr2和cdr3序列[207],
g)重链可变(vh)区,其包含seqidno:48、49和50的cdr1、cdr2和cdr3序列[226],和
h)包含cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区,当与a)至g)中任一项所定义的cdr1、cdr2和cdr3序列相比时,所述cdr1、cdr2和cdr3序列总共包含最多1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个氨基酸取代。
48.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区:
a)重链可变(vh)区,其包含seqidno:6、7和8的cdr1、cdr2和cdr3序列[059],
b)重链可变(vh)区,其包含seqidno:41、42和43的cdr1、cdr2和cdr3序列[207],
c)重链可变(vh)区,其包含seqidno:48、49和50的cdr1、cdr2和cdr3序列[226];和
d)包含cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区,当与a)至c)中任一项所定义的cdr1、cdr2和cdr3序列相比时,所述cdr1、cdr2和cdr3序列总共包含最多1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个氨基酸取代。
49.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区,其包含seqidno:6、7和8的cdr1、cdr2和cdr3序列[059]。
50.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区:包含seqidno:41、42和43的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区[207]。
51.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区:包含seqidno:48、49和50的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区[226]。
52.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区:
a)分别包含seqidno:6、7和8的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:10、aas和seqidno:11的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[059],
b)分别包含seqidno:13、14和15的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:17、das和seqidno:18的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[076],
c)分别包含seqidno:20、21和22的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:24、das和seqidno:25的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[085],
d)分别包含seqidno:27、28和29的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:31、dvs和seqidno:32的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[106],
e)分别包含seqidno:34、35和36的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:38、das和seqidno:39的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[127],
f)分别包含seqidno.:41、42和43的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:45、das和seqidno:46的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[207],
g)分别包含seqidno.:48、49和50的cdr1、cdr2和cdr3序列的重链可变(vh)区和分别包含seqidno:52、das和seqidno:53的cdr1、cdr2和cdr3序列的轻链可变(vl)区[226];和
h)重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区,每个区包含cdr1、cdr2和cdr3序列,当与a)至g)中任一项所定义的cdr1、cdr2和cdr3序列相比时,所述cdr1、cdr2和cdr3序列总共包含最多1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个氨基酸取代。
53.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中当与以下项相比时,所述能够结合5t4的抗原结合区的六个互补决定区(cdr)总共包含最多1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个氨基酸取代;
iv)seqidno:6、7、8、10、aas和seqidno:11的cdr序列[059],
v)seqidno:41、42、43、45、das和seqidno:46的cdr序列[207];或
vi)seqidno:48、49、50、52、das和seqidno:53的cdr序列[226]。
54.根据权利要求22至29中任一项的抗体,其中所述氨基酸取代中的1,如2、3、4、5、6、7、8、9或10个是保守氨基酸取代。
55.根据前述权利要求中任一项的抗体,所述抗体包含一个或两个重链可变区,其中互补决定区3(cdr3)包含以seqidno:102(yygmdv)所示的序列的六个连续氨基酸残基[059,207,226]。
56.根据权利要求55的抗体,其中所述六个连续氨基酸残基是cdr3内最c端的氨基酸残基。
57.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含一个或两个重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区,所述重链可变区包含seqidno:41(ggsfsgyy)的cdr1序列、seqidno:103(idhsx1st)的cdr2序列和seqidno:104(ax2wfgelx3x4yyygmdv)的cdr3序列,所述轻链可变区包含seqidno:105(qsvssx5)的cdr1序列、cdr2序列das和seqidno:46(qqrsnwplt)的cdr3序列,其中x1是g或e,x2是a或g,x3是w或y,x4是d或h,并且x5是y或f[207,226]。
58.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区[059],所述重链可变区包含分别为seqidno:6、7和8的cdr1、cdr2和cdr3序列,所述轻链可变区包含分别为seqidno:10、aas和seqidno:11的cdr1、cdr2和cdr3序列。
59.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区[207],所述重链可变区包含分别为seqidno:41、42和43的cdr1、cdr2和cdr3序列,所述轻链可变区包含分别为seqidno:45、das和seqidno:46的cdr1、cdr2和cdr3序列。
60.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区[226],所述重链可变区包含分别为seqidno:48、49和50的cdr1、cdr2和cdr3序列,所述轻链可变区包含分别为seqidno:52、das和seqidno:53的cdr1、cdr2和cdr3序列。
61.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区:
a)重链可变(vh)区,其包含seqidno:5的序列或与seqidno:5的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[059],
b)重链可变(vh)区,其包含seqidno:12的序列或与seqidno:12的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[076],
c)重链可变(vh)区,其包含seqidno:19的序列或与seqidno:19的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[085],
d)重链可变(vh)区,其包含seqidno:26的序列或与seqidno:26的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[106],
e)重链可变(vh)区,其包含seqidno:33的序列或与seqidno:33的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%的氨基酸序列同一性的序列[127],
f)重链可变(vh)区,其包含seqidno:40的序列或与seqidno:40的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[207];和
g)重链可变(vh)区,其包含seqidno:47的序列或与seqidno:47的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[226]。
62.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区,其包含seqidno:5的序列或与seqidno:5的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%的氨基酸序列同一性的序列[059]。
63.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区,其包含seqidno:40的序列或与seqidno:40的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%的氨基酸序列同一性的序列[207]。
64.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变(vh)区,其包含seqidno:47的序列或与seqidno:47的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%的氨基酸序列同一性的序列[226]。
65.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区:
a)包含seqidno:5的序列或与seqidno:5的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:9的序列或与seqidno:9的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[059],
b)包含seqidno:12的序列或与seqidno:12的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:16的序列或与seqidno:16的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[076],
c)包含seqidno:19的序列或与seqidno:19的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:23的序列或与seqidno:23的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[085],
d)包含seqidno:26的序列或与seqidno:26的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:30的序列或与seqidno:30的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[106],
e)包含seqidno:33的序列或与seqidno:33的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:37的序列或与seqidno:37的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[127],
f)包含seqidno:40的序列或与seqidno:40的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:44的序列或与seqidno:44的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[207],
g)包含seqidno:47的序列或与seqidno:47的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:51的序列或与seqidno:51的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列的轻链可变(vl)区[226]。
66.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述能够结合5t4的抗原结合区包含选自下组的重链可变(vh)区和轻链可变(vl)区:
a)包含seqidno:5序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:9序列的轻链可变(vl)区[059],
b)包含seqidno:12序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:16序列的轻链可变(vl)区[076],
c)包含seqidno:19的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:23的序列的轻链可变(vl)区[085],
d)包含seqidno:26的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:30的序列的轻链可变(vl)区[106],
e)包含seqidno:33序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:37序列的轻链可变(vl)区[127],
f)包含seqidno:40序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:44序列的轻链可变(vl)区[207];和
g)包含seqidno:47的序列的重链可变(vh)区和包含seqidno:51的序列的轻链可变(vl)区[226]。
67.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体是全长抗体,如全长igg1抗体。
68.根据前述权利要求中任一项的抗体,其是单价抗体。
69.根据前述权利要求中任一项的抗体,其是二价抗体。
70.根据前述权利要求中任一项的抗体,其是单特异性抗体。
71.根据前述权利要求中任一项的抗体,其是双特异性抗体。
72.根据前述权利要求中任一项的抗体,其包含结合cd3,如人cd3ε(epsilon),诸如如seqidno:4中规定的人cd3ε(epsilon)的抗体的抗原结合区。
73.根据权利要求72的抗体,其中所述结合cd3的抗原结合区包含
重链可变(vh)区,其包含分别为seqidno:54、55和56的cdr1、cdr2和cdr3序列;[野生型抗cd3(sp34/人源化sp34,wo2015001085(genmab))-vhcdr序列];
以及任选地
轻链可变(vl)区,其包含分别为seqidno:58、gtn和59的cdr1、cdr2和cdr3序列[野生型抗cd3,vlcdr序列]。
74.根据权利要求72或73的抗体,其中所述结合cd3的抗原结合区包含
重链可变(vh)区,其包含seqidno:57的序列或与seqidno:57的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[野生型抗cd3-vh全长序列];
以及任选地
轻链可变(vl)区,其包含seqidno:60的序列或与seqidno:60的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[野生型抗cd3-vl全长序列]。
75.根据权利要求72至74中任一项的抗体,其中所述抗体比具有包含以seqidno:57所示的vh序列和以seqidno:60所示的vl序列[野生型抗cd3(人源化sp34,wo2015001085(genmab))vh和vl序列]的抗原结合区的抗体具有更低的人cd3ε结合亲和力,优选其中所述亲和力低至少5倍,如低至少10倍,例如低至少20倍,低至少30倍,低至少40倍,低至少45倍或如低至少50倍。
76.根据权利要求72至74中任一项的抗体,其中所述抗原结合区以200–1000nm的范围内,如300–1000nm的范围内,400–1000nm的范围内,500–1000nm的范围内,300–900nm的范围内,400–900nm的范围内,400–700nm的范围内,500–900nm的范围内,500–800nm的范围内,500–700nm的范围内,600–1000nm的范围内,600–900nm的范围内,600–800nm的范围内,或如600–700nm的范围内的平衡解离常数kd结合cd3。
77.根据权利要求72或75的抗体,其中所述抗原结合区以1–100nm的范围内,如5–100nm的范围内,10–100nm的范围内,1–80nm的范围内,1–60nm的范围内1–40nm的范围内,1–20nm的范围内,5–80nm的范围内,5–60nm的范围内,5–40nm的范围内,5–20nm的范围内,10–80nm的范围内,10–60nm的范围内,10–40nm的范围内,或如10–20nm的范围内的平衡解离常数kd结合cd3。
78.根据权利要求72至77中任一项的抗体,其中
所述结合cd3的抗原结合区包含重链可变(vh)区,所述重链可变区包含cdr1序列、cdr2序列和cdr3序列,
当与包含以seqidno:57所示的序列的重链可变(vh)区相比时,所述重链可变(vh)区在所述cdr序列之一中具有氨基酸取代,所述取代位于选自下组的位置处:t31、n57、h101、g105、s110和y114,所述位置根据seqidno:57[vh_hucd3-h1l1]的序列编号;和
所述野生型轻链可变(vl)区包含分别以seqidno:58、gtn和seqidno:59所示的cdr1、cdr2和cdr3序列。
79.根据权利要求72的抗体,其中当与以seqidno:57所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3比较时,所述结合cd3的抗原结合区的重链可变(vh)区的cdr1、cdr2和cdr3总共包含最多1、2、3、4或5个氨基酸取代。
80.根据权利要求72或73的抗体,其中所述结合cd3的抗原结合区的重链可变(vh)区的cdr1、cdr2和cdr3的氨基酸序列与所述野生型重链可变(vh)区的cdr1、cdr2和cdr3的氨基酸序列具有至少95%的序列同一性,如至少96%的序列同一性,至少97%的序列同一性,至少98%的序列同一性或至少99%的序列同一性,序列同一性是基于比对由所述结合cd的抗原结合区的重链可变(vh)区的cdr1、cdr2和cdr3的序列组成的氨基酸序列与包含所述野生型重链可变(vh)区的cdr1、cdr2和cdr3序列的氨基酸序列计算的。
81.根据权利要求72至74的抗体,其中所述结合cd3的抗原结合区包含选自下组的突变:t31m、t31p、n57e、h101g、h101n、g105p、s110a、s110g、y114m、y114r、y114v。
82.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中当所述抗体是缺乏fc介导的效应器功能或具有降低的fc介导的效应器功能的双特异性抗体(“惰性”抗体),并且包含结合cd3的抗体的抗原结合区时,则抗体:
a)当使用纯化的pbmc或t细胞作为效应细胞时,能够介导sk-ov-3细胞的浓度依赖性细胞毒性,例如,当如本文实施例14所述的那样测定时,
b)当使用纯化的t细胞作为效应细胞时,能够介导mda-mb-231细胞的浓度依赖性细胞毒性,例如,当如本文实施例13所述的那样测定时,
c)能够在mda-mb-231肿瘤细胞存在下体外活化t细胞;例如如本文实施例13所述的那样测定时,
d)能够在bxpc-3、panc-1、caski和/或siha肿瘤细胞存在下体外活化t细胞;例如如本文实施例17所述的那样测定时,
e)当使用纯化的t细胞作为效应细胞时,能够诱导bxpc-3、panc-1、caski和/或siha肿瘤细胞的细胞毒性,例如当如本文实施例17所述的那样测定时;和/或
f)在人源化免疫造血干细胞重建小鼠异种移植物模型,如用人mda-mb-231肿瘤细胞接种的nod.cg-prkdcscidil2rgtm1wjl/szj中显示抗肿瘤活性,如延迟的肿瘤长出;例如当如实施例15所述的那样测定时。
83.根据权利要求82的抗体,其中所述抗体介导sk-ov-3细胞的浓度依赖性细胞毒性的能力是在体外细胞毒性测定法中测定的,所述测定法包括以下步骤:
i)从健康人供体血沉棕黄层中分离外周血单个核细胞(pbmc)或t细胞,
ii)提供
第一组样品,其中每个样品包含pbmc和人卵巢腺癌sk-ov-3细胞,并且其中所述样品中pbmc:sk-ov-3细胞的比例为1:2,1:1,2:1,4:1,8:1和12:1;和
第二组样品,其中每个样品包含t细胞和人卵巢腺癌sk-ov-3细胞,并且其中所述样品中t细胞:sk-ov-3细胞的比例为1:2,1:1,2:1,4:1和8:1
iii)以范围为0.0128ng/ml至1000ng/ml的浓度向每组样品添加所述抗体,并在37℃将所述样品温育72小时;然后
iv)使用刃天青(7-羟基-3h-吩恶嗪-3-酮10-氧化物)评估所述sk-ov-3细胞的存活力。
84.根据权利要求82的抗体,其中在包括以下步骤的测定法中测定在mda-mb-231肿瘤细胞存在下在体外活化t细胞的能力:
i)从健康人供体血沉棕黄层中分离t细胞,
ii)提供一组样品,其中每个样品包含t细胞和人乳腺癌mda-mb-231细胞,并且其中所述样品中t细胞:mda-mb-231细胞的比例为8:1,
iii)将所述抗体以范围为0.0128ng/ml至1000ng/ml的浓度添加到该组样品,并在37℃将所述样品温育72小时,
iv)通过在4℃与所述抗体一起温育30分钟,用荧光标记的针对t细胞活化标志物的抗体,如cd69-apc、cd25-pe-cy7和cd279/pd1-bv604抗体对所述t细胞染色;并且
v)通过流式细胞仪分析所述样品。
85.根据权利要求82的抗体,其中通过包括以下步骤的程序测定在bxpc-3、panc-1、caski和/或siha肿瘤细胞的存在下体外活化t细胞:
i)提供从健康人类供体血沉棕黄层分离的t细胞,
ii)提供一组样品,其中每个样品包含所述t细胞和bxpc-3、panc-1、caski或siha肿瘤细胞,并且其中所述样品中t细胞:肿瘤细胞的比例为4:1,
iii)将所述抗体以范围为0.0128ng/ml至5000ng/ml的浓度(例如5倍稀释)添加到该组样品,并在37℃将所述样品温育72小时,
iv)从每个样品中收集110μl含t细胞的上清液,并用针对t细胞标志物的荧光标记的抗体,如cd3-efluor450、cd4-apc-efluor780、dc8-af700,和用针对t细胞标志物的抗体,如69-apc、cd25-pe-cy7和cd279/pd1-bv604抗体对t细胞进行染色,通过在4℃与所述抗体温育30分钟进行;并且
v)通过流式细胞仪分析所述样品。
86.根据权利要求82的抗体,其中通过包括以下步骤的程序测定诱导bxpc-3、panc-1、caski和/或siha肿瘤细胞的细胞毒性的能力:
i)提供从健康人类供体血沉棕黄层分离的t细胞,
ii)提供一组测试样品和对照样品,其中每个样品包含已经允许粘附至96孔组织培养板底部的bxpc-3、panc-1、caski或siha肿瘤细胞和所述t细胞,并且其中所述样品中的t细胞:肿瘤细胞的比例为4:1,
iii)将所述抗体以范围为0.0128ng/ml到5000ng/ml的浓度(例如5倍稀释)添加到该组测试样品,而所述对照样品保持未处理或与5μm星形孢菌素一起温育,然后在37℃将所有样品温育72小时,
iv)在补充有10%(w/w)含铁的供体牛血清和青霉素/链霉素的rpmi-1640培养基中的10%(w/w)7-羟基-3h-吩恶嗪-3-酮10-氧化物(刃天青)中在37℃温育粘附细胞4小时,
v)测量所述细胞的吸光度;将与星形孢菌素温育的细胞的吸光度设置为0%存活力,并且将未处理的细胞的吸光度设置为100%存活力,并且如下计算活细胞百分比:
87.根据权利要求72和78至84中任一项的抗体,其中所述能够结合cd3的抗原结合区包含:
a)包含分别具有以seqidno:61、55和56所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[vhcdr1-t31p+野生型vhcdr2,3]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
b)包含分别具有以seqidno:63、55和56所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[vhcdr1-t31m+野生型vhcdr2,3]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
c)包含分别具有以seqidno:54、65和56所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[vhcdr-n57e+野生型vhcdr1,3]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
d)包含分别具有以seqidno:54、55和67所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-h101g]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
e)包含分别具有以seqidno:54、55和69所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-h101n]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
f)包含分别具有以seqidno:54、55和71所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-g105p]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
g)包含分别具有以seqidno:54、55和73所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-s110a]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
h)包含分别具有以seqidno:54、55和75所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-s110g]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
i)包含分别具有以seqidno:54、55和77所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-y114v]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
j)包含分别具有以seqidno:54、55和79所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-y114m]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl),或
k)包含分别具有以seqidno:54、55和81所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-y114r]的重链可变区(vh)和包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]的轻链可变区(vl)。
88.根据权利要求72和78至85中任一项的抗体,其中所述能够结合cd3的抗原结合区包含重链可变区(vh)和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别具有以seqidno:54、55和67所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-h101g],所述轻链可变区包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]。
89.根据权利要求72和78至85中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh)和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别为seqidno:6、7和8的cdr1、cdr2和cdr3序列,所述轻链可变区包含分别为seqidno:10、aas和seqidno:11的cdr1、cdr2和cdr3序列[059],
和
所述能够结合cd3的抗原结合区包含重链可变(vh)区和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别具有以seqidno:54、55和67所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-h101g],所述轻链可变区包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]。
90.根据权利要求72和78至85中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh)和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别为seqidno:41、42和43的cdr1、cdr2和cdr3序列,所述轻链可变区包含分别为seqidno:45、das和seqidno:46的cdr1、cdr2和cdr3序列[207],
和
所述能够结合cd3的抗原结合区包含重链可变(vh)区和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别具有以seqidno:54、55和67所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-h101g],所述轻链可变区包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]。
91.根据权利要求47和51至59中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh)和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别为seqidno:48、49和50的cdr1、cdr2和cdr3序列,所述轻链可变区包含分别为seqidno:52、das和seqidno:53的cdr1、cdr2和cdr3序列[207],
和
所述能够结合cd3的抗原结合区包含重链可变(vh)区和轻链可变区(vl),所述重链可变区包含分别具有以seqidno:54、55和67所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vhcdr1,2+vhcdr3-h101g],所述轻链可变区包含分别具有以seqidno:58所示的序列、序列gtn和以seqidno:59所示的序列的cdr1、cdr2和cdr3[野生型vlcdr1、2、3]。
92.权利要求72和78至91中任一项的抗体,其中所述能够结合人cd3的抗原结合区包含选自下组的vh序列和vl序列:
a)以seqidno:62所示的vh序列[vht31p全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列[野生型全长序列],
b)以seqidno:64所示的vh序列[vht31m全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
c)以seqidno:66所示的vh序列[vhn57e全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
d)以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
e)以seqidno:70所示的vh序列[vhh101n全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
f)以seqidno:72所示的vh序列[vhg105p全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
g)以seqidno:74所示的vh序列[vhs110a全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
h)以seqidno:76所示的vh序列[vhs110g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
i)以seqidno:78所示的vh序列[vhy114v全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列,
j)以seqidno:80所示的vh序列[vhy114m全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列;和
k)以seqidno:82所示的vh序列[vhy114r全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
93.根据权利要求72和78至92中任一项的抗体,其中所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
94.根据权利要求78至93中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh),所述重链可变区包含seqidno:5的序列或与seqidno:5的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[059-vh全长序列];
和
所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
95.根据权利要求72和78至93中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh),所述重链可变区包含seqidno:40的序列或与seqidno:40的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[207-vh全长序列];和
所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
96.根据权利要求47和51至64中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh),所述重链可变区包含seqidno:47的序列或与seqidno:47的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[226-vh全长序列];和
所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
97.权利要求72和78至94中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh),所述重链可变区包含seqidno:5的序列或与seqidno:5的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列[059];
和
所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
98.根据权利要求72、78至93和95中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh)和重链轻区(vl)[207–vh+vl全长序列],所述重链可变区包含seqidno:40的序列或与seqidno:40的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列,所述重链轻区包含seqidno:44的序列或与seqidno:44的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列;
和
所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
99.根据权利要求72、78至93和96中任一项的抗体,其中
所述能够结合5t4的抗原结合区包含重链可变区(vh)和重链轻区(vl)[226–vh+vl全长序列],所述重链可变区包含seqidno:47的序列或与seqidno:47的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列,所述重链轻区包含seqidno:51的序列或与seqidno:51的序列具有至少90%、至少95%、至少97%或至少99%氨基酸序列同一性的序列;
和
所述能够结合人cd3的抗原结合区包含以seqidno:68所示的vh序列[vhh101g全长序列]和以seqidno:60所示的vl序列。
100.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中每个抗原结合区包含重链可变区(vh)和轻链可变区(vl),并且其中所述可变区各自包含三个cdr序列,分别为cdr1、cdr2和cdr3,以及四个框架序列,分别为fr1、fr2、fr3和fr4。
101.根据权利要求100的抗体,其中所述抗体包含两个重链恒定区(ch)和两个轻链恒定区(cl)。
102.根据权利要求100或101的抗体,其中所述抗体包含第一和第二重链,所述第一和第二重链各自至少包含铰链区、ch2和ch3区,其中在所述第一重链中,与选自人igg1重链中t366、l368、k370、d399、f405、y407和k409的位置相对应的位置中的至少一个氨基酸已经被取代,并且在所述第二重链中,与选自人igg1重链中t366、l368、k370、d399、f405、y407和k409的位置相对应的位置中的至少一个氨基酸已经被取代,其中所述第一和所述第二重链的所述取代不在同一位置中,并且其中所述氨基酸位置根据eu编号进行编号。
103.根据权利要求100至102中任一项的抗体,其中与人igg1重链中的k409相对应的位置中的氨基酸在所述第一重链中为r,而与人igg1重链中的f405相对应的位置中的氨基酸在所述第二条重链中为l,反之亦然。
104.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体包含第一和第二重链,并且其中在所述第一和第二重链两者中,与根据eu编号的人igg1重链中的位置l234和l235相对应的位置处的氨基酸残基分别为f和e。
105.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体包含第一和第二重链,并且其中在所述第一和第二重链两者中,与根据eu编号的人igg1重链中的位置d265相对应的位置处的氨基酸残基为a。
106.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中
a)所述能够结合5t4的抗原结合区是人源化的,和/或
b)若存在的话,所述能够结合cd3的抗原结合区是人源化的。
107.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中
a)所述能够结合5t4的抗原结合区是人的,和/或
b)若存在的话,所述能够结合cd3的抗原结合区是人的。
108.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中
a)所述能够结合5t4的抗原结合区是嵌合的,和/或
b)若存在的话,所述能够结合cd3的抗原结合区是嵌合的。
109.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体包含第一重链和任选地第二重链,并且其中所述第一重链和若存在的话所述第二重链是修饰的,使得所述抗体相对于相同的未修饰的抗体在更小程度上诱导fc介导的效应器功能。
110.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体包含kappa(κ)轻链。
111.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体包含lambda(λ)轻链。
112.根据前述权利要求中任一项的抗体,其中所述抗体包含lambda(λ)轻链和kappa(κ)轻链;例如抗体,其具有包含能够结合cd3的结合区的重链和lambda轻链;和包含能够结合5t4的结合区的重链和kappa轻链。
113.免疫缀合物或抗体-药物缀合物(adc),其包含根据前述权利要求中任一项的抗体,以及治疗部分,如细胞毒剂、化学治疗药物、细胞因子、免疫抑制剂、抗生素或放射性同位素。
114.核酸构建体,其包含
a)核酸序列,其编码包含权利要求1-113中任一项所定义的能够结合5t4的抗原结合区的抗体的重链序列,和/或
b)核酸序列,其编码包含权利要求72至113中任一项所定义的能够结合5t4的抗原结合区的抗体的轻链序列。
115.根据权利要求114的核酸构建体,其进一步包含
a)核酸序列,其编码包含权利要求72至113中任一项所定义的能够结合cd3的抗原结合区的抗体的重链序列,和/或
b)核酸序列,其编码包含权利要求72至113中任一项所定义的能够结合cd3的抗原结合区的抗体的轻链序列。
116.表达载体,其包含
a)核酸序列,其编码包含权利要求1-112中任一项所定义的能够结合5t4的抗原结合区的抗体的重链序列,和/或
b)核酸序列,其编码包含权利要求1-112中任一项所定义的能够结合5t4的抗原结合区的抗体的轻链序列。
117.根据权利要求116的表达载体,其进一步包含
a)核酸序列,其编码包含权利要求72至112中任一项所定义的能够结合cd3的抗原结合区的抗体的重链序列,和/或
b)核酸序列,其编码包含权利要求72至112中任一项所定义的能够结合cd3的抗原结合区的抗体的轻链序列。
118.细胞,其包含如权利要求114至115中任一项所定义的核酸构建体或如权利要求116或117中所定义的表达载体,如已经通过用所述核酸构建体或表达载体转染宿主细胞获得的细胞,如重组宿主细胞。
119.根据权利要求118的细胞,其中所述宿主细胞是人来源的,如人胚胎肾(hek)细胞,如hek/expi细胞,或者是啮齿类来源的,例如中国仓鼠卵巢细胞,如cho/n50细胞。
120.组合物,其包含如权利要求1至112中任一项所定义的抗体。
121.药物组合物,其包含如权利要求1至112中任一项所定义的抗体和药学上可接受的载体。
122.如权利要求1至112中任一项所定义的抗体,用作药物。
123.如权利要求1至112中任一项的抗体,用于治疗疾病。
124.根据权利要求122或123使用的抗体,其中所述疾病是癌症。
125.根据权利要求124使用的抗体,其中所述癌症以至少一些肿瘤细胞中5t4的表达为特征。
126.根据权利要求122至125中任一项使用的抗体,其中所述癌症选自下组:肾脏/肾癌、乳腺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、卵巢癌、膀胱癌、子宫/子宫内膜/宫颈癌、肺癌、胃肠癌、胃癌、胰腺癌、甲状腺癌、头和颈癌、淋巴瘤、急性髓样白血病。
127.治疗疾病的方法,所述方法包括向有此需要的受试者施用如权利要求1至112中任一项所定义的抗体、如权利要求120所定义的组合物或如权利要求121所定义的药物组合物。
128.根据权利要求127的方法,所述方法用于治疗癌症。
129.根据权利要求128的方法,其中所述癌症选自下组:肾脏/肾癌、乳腺癌、结肠直肠癌、前列腺癌、卵巢癌、膀胱癌、子宫/子宫内膜/宫颈癌、肺癌、胃肠癌、胃癌、胰腺癌、甲状腺癌、头和颈癌、淋巴瘤、急性髓样白血病。
130.用于产生权利要求1至112中任一项所定义的抗体的方法,其包括以下步骤:
a)培养包含如权利要求114或117中定义的表达载体的宿主细胞;并且
b)从培养基中纯化所述抗体。
131.用于产生根据权利要求1至112中任一项定义的抗体的方法,其包括以下步骤:
a)提供能够结合5t4的抗体,通过在允许表达所述能够结合5t4的抗体的条件下培养包含权利要求116或117所定义的表达载体的宿主细胞,并从培养基中纯化所述能够结合5t4的抗体进行;
b)提供能够结合cd3的抗体,通过在允许表达所述能够结合cd3的抗体的条件下培养包含表达载体的宿主细胞,并且从培养基中纯化所述能够结合cd3的抗体进行,所述表达载体包含
i)核酸序列,其编码包含权利要求72至112中任一项所定义的能够结合cd3的抗原结合区的抗体的重链序列,和
ii)核酸序列,其编码包含权利要求72至112中任一项所定义的能够结合cd3的抗原结合区的抗体的轻链序列;
c)在足以允许铰链区中的半胱氨酸经历二硫键异构化的还原条件下,将所述能够结合5t4的抗体与所述能够结合cd3的抗体一起温育,并且
d)获得所述抗体。
132.试剂盒,如用作伴随诊断/用于在患者群体内鉴定那些具有响应用如权利要求1至112中任一项所定义的抗体或如权利要求113所定义的免疫缀合物或抗体-药物缀合物(adc)的治疗的倾向的患者,或用于预测所述抗体或免疫缀合物或adc在用于治疗患者时的功效的试剂盒,其包含如权利要求1至112中任一项的抗体;以及所述试剂盒的使用说明。
133.抗独特型抗体,其结合如权利要求1至112中任一项所定义的能够结合5t4的抗原结合区。