1.牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
s1,细菌选择培养:将采集的待测样本与ec肉汤培养基进行首次增菌,然后将增菌液以1:8~12的比例转移至新鲜的ec肉汤培养基进行二次增菌;
s2,stec分离:利用pcr扩增并结合麦康凯选择平板对s1中增菌后的样本进行stec分离;
s3,stec鉴定:将s2中分离得到的阳性单克隆菌株活化于lb平板,然后对活化的菌株进行stx1/2基因扩增、凝胶电泳及成像,显示阳性的,即为stec菌株;
s4,stec保藏,对s3中经过鉴定为stec的菌株进行菌种保藏。
2.根据权利要求1所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌的分离鉴定方法,其特征在于,所述的s1中,首次增菌的具体方法为:将收集的样本称取后加入无菌ec肉汤,振荡均匀,然后培养,得到首次增菌液;其中,样本和无菌ec肉汤的质量比为1:8~12,振荡时间10~20s;
二次增菌的具体方法为,将首次增菌液振荡均匀后,加入无菌ec肉汤,所述的首次增菌液与无菌ec肉汤的质量比为1:8~12,振荡均匀后进行培养;
首次增菌及二次增菌的培养温度都为41~43℃,将混匀的样本悬浮液放置摇床,在转速为180~200rpm的条件下,培养18~24h。
3.根据权利要求1所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌的分离鉴定方法,其特征在于,所述的s2的具体操作为:
s2.1,利用pcr扩增stec所共有的志贺毒素基因(stx1/2),然后经过凝胶电泳及成像判断牛粪样本中是否携带stec菌株,
s2.2,将s2.1中判断为阳性及疑似样本的菌液分别稀释涂布于麦康凯平板上,然后在每个样本中挑取20个疑似菌落涂抹于lb平板四个区域,
s2.3,在s2.2中所述的四个区域中,每个区域5株菌混合并进行stx1/2基因扩增,根据凝胶电泳及成像来判断每个区域中的5个菌落中是否存在产志贺毒素菌株,所述基因扩增采用pcr扩增方法;
s2.4,经s2.3检测判断为阳性的区域,则继续将该阳性区域中的每株菌进行stx1/2基因扩增,进而判断哪个菌落为产志贺毒素菌株;所述基因扩增采用pcr扩增方法。
菌液稀释涂布时,阳性及疑似样本的稀释倍数是10-4,10-5和10-6,涂布量为48~52μl;
将菌液滴于麦康凯平板的五个区域,五个区域分别为:左上,左下,右上,右下和中部区域。涂布滴加菌液于五个区域,目的是将菌液均匀涂布;
进行pcr扩增时使用的dna模板均是通过煮沸法制得。
4.根据权利要求3所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,所述的s2.2中菌落挑取具体操作为:选取菌落数在30~300之间的麦康凯平板进行挑菌,一个样本挑取一个平板,将该平板用十字线划分为四个区域;四个区域分别为:左上,左下,右上和右下,十字线划分四个区域,目的是提高目的菌株的挑取概率,在上述的四个区域中,各挑取5个单菌落,置于lb平板对应的四个区域,区域编号为1,2,3和4。
5.根据权利要求1所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,所述的s3的具体步骤为:
s3.1,对已经确定的阳性区域进行单克隆菌株鉴定,具体步骤为:
s3.1.1对经s2中鉴定为阳性区域的5个单克隆菌落进行编号;用无菌牙签取少量的菌体涮于500μl的无菌ddh2o,并做好编号;
s3.1.2涡旋振荡10~20s,13000rpm离心5min,弃去上清,重复两次;将清洗两次的菌体,加入300μl的无菌ddh2o,吹吸混匀,并涡旋振荡10~20s;
s3.1.3将准备好的菌悬液放入事前预热好的金属加热器,100℃加热煮沸15min,然后将煮沸后的菌液于4℃冰箱放置5min;
s3.1.4将煮沸冷却后的菌液与离心机,13000rpm离心10min,吸取200μl上清即为dna模板,然后进行pcr扩增操作,若模板不立即使用,保存于-20℃冰箱中;
s3.2,进行stec鉴定:将扩增后阳性的单克隆菌株活化于lb平板,37℃恒温培养箱培养18~24h,并利用pcr扩增stx1/2基因,再利用凝胶电泳及成像来确定得到的即为产志贺毒素大肠埃希氏菌。
6.根据权利要求1所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,所述的s4具体为:用棉签将菌体涮于装有1.2ml40%lb-甘油的冻存管中,于-80℃的冰箱进行保存。
7.根据权利要求1-6任一项所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌的分离鉴定方法,其特征在于,所述的dna模板的制备方法为:
(1)将金属加热器开至100℃,稳定30min;
(2)取1ml二次增菌液于1.5mlep管中13000rpm离心5min,弃上清;
(3)加500μl无菌ddh2o将菌体沉淀重悬,13000rpm离心5min,弃去上清,重复两次;
(4)将清洗两次的菌体,加300μl无菌ddh2o重悬并用涡旋振荡器振荡10~20s;
(5)将准备好的菌悬液放入事前预热好的金属加热器,加热煮沸15min;
(6)将煮沸后的菌液于4℃冰箱放置5min;
(7)将冷却后煮沸的菌液与离心机13000rpm离心10min,吸取200μl上清即为dna模板,若模板不立即使用,保存于-20℃冰箱中。
8.根据权利要求1-6任一项所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,所述的pcr扩增时,反应体系和反应条件如下:pcr反应体系:dna模板5μl,10×pcrbuffer2.5μl,mgcl21.5μl,dntp2μl,taqdna聚合酶0.125μl,上下游引物各为0.3μl,ddh2o13.275μl。pcr反应条件:95℃预变性5min;94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸45s,30个循环;72℃终延伸10min,4℃保存。
9.根据权利要求1-6任一项所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,所述的pcr扩增操作的具体步骤为,
(a)按照反应体系和样本数量计算试剂总用量(注:通常多算1-2个样的体系)
(b)混合体系的配制:试剂全部溶解后,振荡混匀。根据反应体系按步加入,混匀并且离心,置于冰盒上备用;
(c)分装:将pcr管和已配好的体系都置于冰上,先加入事先配好的体系20μl,然后将5μldna模板加入对应标号的pcr管中,记录编号;
(d)pcr扩增:将pcr管管壁上的溶液进行短暂离心,小心取出,按顺序放入pcr仪,再次确认每个pcr管盖子已盖好。设定pcr程序进行扩增。
10.根据权利要求1-6任一项所述的牛粪中非o157产志贺毒素大肠埃希氏菌分离鉴定方法,其特征在于,所述的凝胶电泳及成像方法的具体操作步骤为:
(i)电泳:配制1%琼脂糖,微波煮沸三次,待冷却到50℃,加入eb染料混匀,缓慢的倒入事先插好梳子的胶板,半小时后拔出梳子,然后每孔上样5μlpcr产物,缓慢放入0.5×tris-borate-edta缓冲区,最后设定程序120v,90ma电泳35min;
(ii)成像:将电泳结束的凝胶放入成像系统中成像,根据成像结果对应的mark区间,是否与引物大小相一致来判断基因的检出,并做好记录。