一种用于检测HCV1型耐药突变基因的检测方法及应用与流程

文档序号:25613037发布日期:2021-06-25 15:26阅读:来源:国知局

技术特征:
1.一种hcv 1型耐药突变基因的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)获取待测hcv rna样品;(2)以待测样本的rna为模板,采用扩增引物组进行两次rt

pcr扩增;(3)回收步骤(1)的产物,测序后进行耐药性分析。2.根据权利要求1所述检测方法,其特征在于,所述耐药性分析为测序结果与hcv1型参考株的序列进行比对,确认耐药相关突变位点是否发生变异。3.根据权利要求2所述检测方法,其特征在于,所述耐药相关突变位点为第36位的缬氨酸、第41位的谷氨酰胺、第43位的苯丙氨酸、第54位的苏氨酸、第55位的缬氨酸、第56位的酪氨酸、第80位的谷氨酰胺、第122位的丝氨酸、第155位的精氨酸、第156位的丙氨酸、第158位的缬氨酸、第168位的天冬氨酸、第170位的异亮氨酸/缬氨酸和第175位的亮氨酸/甲硫氨酸中的至少一种。4.根据权利要求2所述检测方法,其特征在于,所述hcv1型参考株为nc_004102和/或aj238799.1。5.根据权利要求1所述检测方法,其特征在于,所述扩增引物组包括至少一对外引物和至少一对内引物;所述外引物对的序列如seq id no.1

seq id no.2所示,所述内引物对序列如seq id no.3

seq id no.4所示。6.根据权利要求1所述检测方法,其特征在于,所述扩增引物组包括至少一对外引物和至少一对内引物;所述外引物对的序列如seq id no.5

seq id no.6所示,所述内引物对序列如seq id no.7

seq id no.8所示。7.根据权利要求1所述检测方法,其特征在于,所述扩增引物组包括至少一对外引物和至少一对内引物;所述外引物对的序列如seq id no.1

seq id no.2和seq id no.5

seq id no.6所示,所述内引物对序列如seq id no.3

seq id no.4和seq id no.7

seq id no.8所示。8.一种用于检测hcv 1a亚型ns3耐药突变基因的扩增引物组,其特征在于,所述扩增引物组包括一对外引物和一对内引物;所述外引物对的序列为seq id no.1

seq id no.2所示的反向互补序列,所述内引物对的序列为seq id no.3

seq id no.4所示的反向互补序列;或所述外引物对的序列如seq id no.1

seq id no.2所示,所述内引物对的序列如seq id no.3

seq id no.4所示的反向互补序列。9.一种用于检测hcv 1a亚型ns3耐药突变基因的扩增引物组,其特征在于,所述扩增引物组包括一对外引物和一对内引物;所述外引物对的序列为seq id no.1

seq id no.2所示的反向互补序列,所述内引物对的序列为seq id no.3

seq id no.4所示的反向互补序列;或所述外引物对的序列如seq id no.1

seq id no.2所示,所述内引物对的序列如seq id no.3

seq id no.4所示的反向互补序列。10.一种用于检测hcv 1b亚型ns3耐药突变基因的扩增引物组,其特征在于,所述扩增引物组包括一对外引物和一对内引物;所述外引物对的序列如seq id no.5

seq id no.6所示,所述内引物对序列如seq id no.7

seq id no.8所示;或所述外引物对的序列为seq id no.5

seq id no.6所示的反向互补序列,所述内引物对序列如seq id no.7

seq id no.8所示。11.一种用于检测hcv 1b亚型ns3耐药突变基因的扩增引物组,其特征在于,所述扩增
引物组包括一对外引物和一对内引物;所述外引物对的序列为seq id no.5

seq id no.6所示的反向互补序列,所述内引物对的序列为seq id no.7

seq id no.8所示的反向互补序列;或所述外引物对的序列如seq id no.5

seq id no.6所示,所述内引物对的序列如seq id no.7

seq id no.8所示的反向互补序列。12.权利要求8

11中任一项所述扩增引物组在制备用于检测hcv 1型耐药突变基因试剂中的应用。13.一种用于检测hcv 1型耐药突变基因的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求8

11任一项所述扩增引物组。
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