一种单细胞内RNA全转录组标记和测序的方法

文档序号:34548357发布日期:2023-06-27 22:24阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种单细胞内rna全转录组标记的方法,所述方法包括:

2.一种单细胞内rna全转录组测序的方法,所述方法包括:

3.一种单细胞内rna m6a修饰组测序的方法,所述方法包括:

4.一种单细胞内rna结合蛋白结合位点的测序方法,所述方法包括:

5.权利要求2或3的方法,其中,在步骤(2)中,富集具体包括如下步骤:

6.权利要求2-4任一项的方法,其中,在步骤(2)中,富集具体包括如下步骤:

7.权利要求4-6任一项的方法,所述建立rna文库的方法包括:

8.权利要求3-7任一项的方法,其中,所述醇沉的步骤包括:将sds、蛋白酶k和tritonx-100溶液与细胞接触;然后提取rna;然后加入乙醇、醋酸钠以及糖原。

9.权利要求1-8任一项的方法,在步骤(3)中,具有选自下列的一项或多项特征:

10.权利要求1-9任一项的方法,其中,在步骤(1)中,使1%-5%(例如,1%,2%,3%,4%,5%)甲醛与细胞接触,冰上放置10min-30min(例如,15min),加入5%digitonin,评估细胞通透的情况;

11.权利要求1-10任一项的方法,其中,在步骤(2)中,细胞内rna打断的方法为通过离子和高温加热方法或rna酶切方法;

12.权利要求1-11任一项的方法,其中,在步骤(2)中,3’末端修复的方法为:使打断的rna与核酸聚合酶(例如,t4 pnk酶)接触。

13.权利要求1-12任一项的方法,其中,在步骤(4)中,通过流式细胞术分选单细胞。

14.一种试剂盒,其包含:

15.权利要求14的试剂盒,所述试剂盒具有选自下列的一项或多项特征:

16.权利要求14或15所述的试剂盒在单细胞内rna全转录组标记中的用途;或在单细胞内rna全转录组测序中的用途;或在单细胞内rna m6a修饰组测序中的用途;或用于单细胞内rna结合蛋白结合位点的测序中的用途。


技术总结
本申请一种单细胞内RNA全转录组标记的方法。进一步的,涉及一种单细胞内RNA全转录组测序的方法,以及一种单细胞内RNA m<supgt;6</supgt;A修饰测序方法和一种单细胞内RNA结合蛋白结合位点的测序方法。本申请的方法实现了单细胞水平的RNA标记,并且提供了高通量单细胞RNA m<supgt;6</supgt;A标记及测序的方法。

技术研发人员:杨运桂,姚欢,杨莹,王梦柯,宋鸽鸽
受保护的技术使用者:中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
技术研发日:
技术公布日:2024/1/13
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