一种无核酸扩增可视化的RNA定量检测方法

文档序号:30953021发布日期:2022-07-30 08:32阅读:来源:国知局

技术特征:
1.一种无核酸扩增可视化的rna定量检测方法,其特征在于,所述rna定量检测方法包括:s1:设计制备crispr-cas13系统响应的rna交联dna水凝胶;s2:将s1制备的dna水凝胶固定在毛细管末端形成超薄dna水凝胶薄膜,由超薄dna水凝胶薄膜与毛细管共同组成自驱动dna水凝胶传感器;s3:设计合成靶标rna特异性的crrna;s4:将crrna、cas13蛋白和已知浓度靶标rna在适当缓冲溶液中共同孵育后,获得含有已知浓度的靶标rna分子样品溶液;s5:将自驱动dna水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标rna分子样品溶液;s6:通过s5中溶液在毛细管中的移动距离,构建靶标rna分子浓度与移动距离之间的线性对应关系;s7:将自驱动dna水凝胶传感器水平浸入含有靶标rna分子的待测样品溶液,根据s6中线性对应关系对待测样品中靶标rna分子进行可视化检测及定量分析。2.根据权利要求1所述的rna定量检测方法,其特征在于,所述s1具体包括:s11:设计合成两条acrydite修饰的dna链,a-dna-x和a-dna-y;s12:设计合成双重功能的交联单链rna,drcl-ssrna;s13:将a-dna-x和a-dna-y分别与丙烯酰胺单体共聚,分别形成直链聚丙烯酰胺-dna pa-x和pa-y;s14:drcl-ssrna包含三个序列区域,3'-和5'-末端的两个序列分别与dna-x和dna-y互补配对,在室温下形成具有三维多孔结构的dna水凝胶。3.根据权利要求2所述的rna定量检测方法,其特征在于,所述s14中dna水凝胶的中间序列为crispr-cas13系统响应序列,即crispr-cas13系统反式切割反应的底物序列。4.根据权利要求1所述的rna定量检测方法,其特征在于,所述s5具体为:将s4所制备的自驱动dna水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标rna分子样品溶液,在毛细作用下,含有靶标rna分子的溶液通过dna水凝胶薄膜进入毛细管。5.根据权利要求1所述的rna定量检测方法,其特征在于,所述s6毛细管中的移动距离具体为:靶标rna分子激活crispr/cas13系统的附属酶切活性,使毛细管末端的dna水凝胶薄膜的通透性增加,靶标rna分子的浓度越大,溶液在毛细管中移动距离越大,且靶标rna分子浓度与溶液在毛细管中移动距离成线性关系。

技术总结
本发明提供了一种无核酸扩增可视化的RNA定量检测方法,包括:S1:设计制备RNA交联的DNA水凝胶;S2:制备自驱动DNA水凝胶传感器;S3:设计合成的特异性的crRNA;S4:将crRNA、Cas13a蛋白和靶标RNA共同孵育含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液;S5:将自驱动DNA水凝胶传感器水平浸入含有已知浓度的靶标RNA分子样品溶液;S6:通过S5中样品溶液在毛细管中的移动距离,构建靶标RNA分子浓度与移动距离之间的线性对应关系;S7:进行可视化检测及定量分析,本发明利用溶液在毛细管中的距离便可实现无需核酸扩增,可视化的RNA定量检测,为RNA为靶标的分子诊断、疾病检测提供新工具。疾病检测提供新工具。疾病检测提供新工具。


技术研发人员:王辉 李正平 王洪红
受保护的技术使用者:北京科技大学
技术研发日:2022.03.11
技术公布日:2022/7/29
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