本发明属于应用方法,具体地说,涉及一种edar pva1370ala突变检测试剂在制备胸腺发育预测评价试剂盒中的应用。
背景技术:
1、我们研究的位点全称为nm_022336.4(edar):c.1109t>c(p.val370ala)。edar是一个编码人类表皮生长因子受体同源蛋白的基因。edar基因位于2号染色体上,总长度为94750bp,包含12个外显子,是可溶性配体eda的受体,可参与调节nf-kb、jnk和半胱氨酸胃蛋白酶信号通路。
2、通过研究发现,edar基因的变异会影响女性乳房的大小,它们会影响人类乳房的发育。
3、edar是外胚层附属物生长发育所必需的蛋白,外胚层附属物生长发育所必需的。edar信号通路在不同类型毛囊的发育、毛发形成和皮脂腺的形态发生中发挥着重要作用,可以控制胚胎和上皮细胞,并调节毛囊细胞的分化过程。
4、这个基因的位点rs3827760有两种类型:突变型和野生型。在欧美和南美人的基因座主要以t基因型为主,为原始的edar基因,也就是edarv370野生型,这会导致女性的乳房较大。而亚洲则是出现了c基因型,是这种基因的突变型,我们称之为edarv370a突变型,会导致女性乳房较小。所以,检测edar基因rs3827760位点是t基因型还是c基因型可以预测胸部未来较大还是较小。
5、为了证明edar基因的作用,科学家们利用转基因小鼠的验证得出结论,edar基因突变的小鼠乳房发育较小。在edar基因突变的影响下降低乳腺脂肪含量。亚洲和欧洲组乳腺的大小与edr基因突变密切相关。当然,370v等基因会使欧洲人和美国人的身体臭味更重,头发发达,头发更细等。还有其他变化,370a基因会让东亚人增加汗腺和皮脂腺,干燥粗糙的头发,并拥有独特的铲形门门齿,edar基因也会导致edar基因变异的亚洲人群拥有粗糙的头发和小乳房。
6、不仅人类进化受到影响,edar基因的研究也有助于了解皮肤和牙齿遗传疾病的发病机制。edar基因突变也已被证明也影响人类头发生长。
7、edar基因的巨大潜力和进一步研究的重要性可以通过在各个领域对edar基因进行广泛研究来认识。edar基因是一个重要的基因,其变异和突变在检测胸腺发育中起着重要作用。
8、有鉴于此特提出本发明。
技术实现思路
1、为解决上述技术问题,本发明采用技术方案的基本构思是:
2、一种edar pva1370ala突变检测试剂在制备胸腺发育评价试剂盒中的应用方法,包括以下工作步骤:
3、第一步:pcr体系配制;
4、收到样本和测试信息后,首先核对样本的名称与测试信息是否一致,无误后再开始实验,本次实验样本编号为1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13,检测位点为edarpva1370ala;
5、第二步:制备微滴;
6、第三步:整理实验数据和制备实验结果图。
7、作为本发明的一种优选实施方式,所述第一步中还包括:
8、将edar_p.val370ala引物与探针结合使用,edar_p.val370ala扩增引物的序列如下:
9、edar_p.val370ala f向引物;tcgagaagactagccgaatgc
10、edar_p.val370ala r向引物;ccctcttcaggccgaagct
11、用于检测的杂交荧光探针序列如下:
12、edar_p.val370ala突变型探针:tctgagaaggctgctg
13、edar_p.val370ala野生型探针:tctgagaaggctgttg
14、按照测试信息取出引物探针并按照要求稀释,方法如下:
15、a、引物探针14000转离心2min,离心后取出根据引物探针管壁上信息加入te;b、加入te后的引物探针涡旋振荡1min,5000转离心30s;
16、c、离心后取出引物探针原液,取2μl原液用无核酶水稀释10倍至1.5ml离心管中,离心管盖上写上对应引物探针名称及稀释日期,涡旋振荡1min,5000转离心30s。
17、作为本发明的一种优选实施方式,所述第一步中还包括:dna用qubit3.0定量,按照测试信息用无核酶水稀释至指定浓度;取出反应预混液(微滴式数字pcr用反应预混液),室温放置2分钟;准备样本制备通用耗材,可穿刺热封膜。在8连管中配制pcr反应体系,反应终浓度引物/探针900nm/250nm;通过旋涡振荡混匀pcr反应混合液,用离心机快速离心,以确保所有成分都在反应管的底部,让反应管在室温下静置3分钟。
18、作为本发明的一种优选实施方式,所述第二步还具体的包括:
19、a、将微滴生成芯片置于芯片卡座中,向油相孔加入50μl微滴生成油,向样本孔中加入20μl已加入模板的pcr反应混合液,然后在各样本孔水相上方加入密封剂,待油相和水相加入完成后,盖上微滴生成芯片密封垫;
20、b、将微滴生成仪和气泵打开,仪器自检完成后,气压泵数值为0.2mpa;轻按红色按钮打开仓门,将微滴生成芯片放入微滴生成仪,长按红色按钮,开始生成微滴;
21、c、待微滴生成后,依次小心将生成的微滴转移至pcr反应板中;
22、d、打开封膜仪,设置一定的封膜仪温度和封膜时间,待温度达标点击开门按钮,打开仓门将96孔板放入底座,盖上可穿刺热封膜,点击关门,点击封膜;封好膜之后进行pcr扩增;
23、e、打开pcr仪,设置pcr仪程序,将封膜完成的96孔板放入,盖上热盖,扭紧热盖上的旋钮,点击运行;
24、f、pcr结束前打开微滴检测仪,打开分析软件,点击清洗,若两天以上未用需点击灌洗;
25、g、清洗结束后在界面左侧录入信息包括样本名称,目的基因1,目的基因2;
26、h、完成后轻按微滴检测仪的红色按钮,打开仓门,取下底座上的盖板,取出pcr结束的样本放入录入信息对应的孔位,压紧盖板,轻按微滴检测仪的红色按钮,关上仓门,点击微滴检测仪的分析软件界面上的运行,等待结果分析完成。
27、作为本发明的一种优选实施方式,所述c中,微滴为45-55μl。
28、作为本发明的一种优选实施方式,所述a中,在各样本孔水相上方加入5μl密封剂。
29、作为本发明的一种优选实施方式,所述f中,pcr结束前10min打开微滴检测仪。
30、作为本发明的一种优选实施方式,所述d中,封好膜之后应于30分钟内进行pcr扩增。
31、作为本发明的一种优选实施方式,所述d中,设置封膜仪温度为190℃,封膜时间为5s。
32、本发明与现有技术相比具有以下有益效果:
33、本发明通过第一步的数字pcr体系配制、第二步的制备微滴和第三步的整理实验数据和制备实验结果图,实现了edar pva1370ala突变检测试剂在制备胸腺发育评价试剂盒中的应用,本发明的应用方法科学且高效,能够有效的检测出edar pva1370ala基因的变异情况;此外,本发明所提供的edar突变检测试剂在制备胸腺发育评价试剂盒中的应用方法,不仅能够验证edar基因对人类与小鼠等动物乳腺发育的影响,还能根据此应用方法来了解毛发、牙齿未来的成长情况,因此本发明所提供的应用方法在对edar基因研究的各个领域上,都拥有较大的重要作用和价值。
34、下面结合附图对本发明的具体实施方式作进一步详细的描述。