技术特征：
1.一种基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)免疫沉淀蛋白预处理：将免疫沉淀实验获得的免疫沉淀蛋白，采用清洗液清洗、蛋白酶酶解以及脱盐处理，获得可供质谱直接检测的肽段和/或蛋白样品；(2)质谱检测：将步骤(1)获得的肽段和/或蛋白样品进行质谱检测，获取质谱图谱的原始数据，搜库解析图谱原始数据，获得肽段和/或蛋白鉴定和定量数据；所述数据包括第1项评估指标样品中总蛋白鉴定和定量情况以及第2项评估指标诱饵蛋白定量数据在总蛋白定量列表中的排名；(3)依据步骤(2)获得的评估指标数据，按照如下评估原则进行评估：样品中总蛋白鉴定和定量情况越好，判断免疫沉淀实验所得样本量越多，效果越好；诱饵蛋白的定量数据在所有蛋白定量数值中排名越高，判断免疫沉淀实验亲和富集效率和特异性越好。2.如权利要求1所述的基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其特征在于，所述第1项评估指标和第2项评估指标，具体按照如下原则进行评估：
①
蛋白鉴定数量和/或总离子色谱图峰面积大于预设阈值，则判断第1项评估指标通过评估，反之，则未通过；所述蛋白鉴定数量预设阈值在300至1500间取值，所述总离子色谱图峰面积预设阈值在2e8至1e10间取值；
②
诱饵蛋白的定量数据在所有蛋白定量数据中的排名小于预设阈值，则判断通过第2项评估指标通过评估，反之，则未通过；所述诱饵蛋白的定量数据在所有蛋白定量数据中的排名的预设阈值在3％至10％取值；上述两项评估指标均通过，则判断免疫沉淀实验成功；若第1项评估指标未通过，则判断免疫沉淀实验样本量不足；若第2项评估指标未通过，则判断免疫沉淀实验亲和富集效率不足。3.如权利要求1或2所述的基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其特征在于，在设置对照组的情况下，所述数据，还包括第3项评估指标诱饵蛋白定量数据在免疫沉淀实验组样品与对照组样品中的差异以及第4项评估指标诱饵蛋白在免疫沉淀实验组与对照组样品间差异程度的排名，并按照如下评估原则进行评估：诱饵蛋白在实验组与对照组间的定量差异越显著，判断免疫沉淀实验亲和富集效率越高；诱饵蛋白在免疫沉淀实验组与对照组间的差异程度排名越高，判断免疫沉淀实验亲和富集特异性越好。4.如权利要求3所述的基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其特征在于，所述第3项评估指标和第4项评估指标，具体按照如下评估原则进行评估：
③
所述诱饵蛋白在实验组与对照组间的定量差异倍数高于预设阈值、定量差异显著性p值或p值校正值低于预设阈值，则判断第3项评估指标通过，反之，则未通过，若第3项评估指标未通过，则判断免疫沉淀实验亲和富集效率不足；所述诱饵蛋白在实验组与对照组间的定量差异倍数的预设阈值在2至10取值；所述定量差异显著性p值或p值校正值的预设阈值为0.01或0.05；
④
诱饵蛋白在免疫沉淀实验组与对照组样品间差异程度的排名小于预设阈值，则判断通过第4项评估指标，反之，则未通过，若第4项评估指标未通过，则判断免疫沉淀实验亲和富集特异性不足；所述诱饵蛋白在免疫沉淀实验组与对照组样品间差异程度的排名的预设阈值在1％至3％，或3至10间取值。5.如权利要求4所述的基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其特征在于，在设置对照组的情况下，所述数据，还包括第5项评估指标免疫沉淀实验组样品和对照组样品中总蛋白鉴定和定量差异，按照如下原则进行评估：实验组与对照组整体定量差异越小，判断对照组设置合理性越好。6.如权利要求5所述的基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其特征在于，所述第5项评估指标，具体按照如下原则进行评估：
⑤
蛋白鉴定数量差异和/或总离子色谱图峰面积差异小于预设阈值，和/或蛋白定量相关系数大于预设阈值，则判断第5项评估指标通过，反之，则未通过；若第5项评估指标通过，判断对照组实验设置合理；所述蛋白鉴定数量差异的预设阈值在5％至40％取值；所述总离子色谱图峰面积差异的预设阈值在5％至40％取值；所述蛋白定量相关系数的预设阈值在0.6至0.95取值。7.一种免疫沉淀实验效果评估系统，其特征在于，包括数据获取模块、判断模块和评估结果显示模块；所述数据获取模块，用于获取待评估免疫沉淀蛋白的肽段和/或蛋白鉴定和定量数据，所述蛋白鉴定和定量数据，包括蛋白鉴定数量、肽段鉴定数量、样品检测总信号值和总离子色谱图峰面积中一种或多种组合参数；ibaq、lfq intensity、intesnity、谱图数、nsaf和saf中一种或多种组合参数；并将数据传输给判断模块；所述判断模块，用于依据接收的数据，按照如下原则进行判断：
①
蛋白鉴定数量和/或总离子色谱图峰面积大于预设阈值，则判断第1项评估指标通过评估，反之，则未通过；所述蛋白鉴定数量预设阈值在300至1500间取值；所述总离子色谱图峰面积预设阈值在2e8至1e10间取值；
②
诱饵蛋白的定量数据在所有蛋白定量数据中的排名低于预设阈值，则判断第2项评估指标通过评估，反之，则未通过；所述诱饵蛋白的定量数据在所有蛋白定量数据中的排名的预设阈值在3％至10％取值；并将判断结果提交给评估结果显示模块；所述评估结果显示模块，用于依据判断结果进行显示，具体如下：在没有设置对照组情况下：第1项评估指标若通过，显示免疫沉淀实验样本量达标，若未通过，显示免疫沉淀实验样本量不足；第2项评估指标若通过，显示免疫沉淀实验亲和富集效率达标，若未通过，显示免疫沉淀实验亲和富集效率不足；若免疫沉淀实验样本量和免疫沉淀实验亲和富集效率均达标，说明免疫沉淀实验成功，若对应评估指标未通过，说明免疫沉淀实验在对应方面存在缺陷，需要改进。8.如权利要求7所述的免疫沉淀实验效果评估系统，其特征在于，所述数据获取模块，在设置对照组实验的情况下，还用于获取定量差异倍数、定量差异
显著性p值和定量差异显著性p值校正值中一种或多种组合参数以及诱饵蛋白定量差异排名；所述判断模块，还按照如下原则判断：
③
所述诱饵蛋白在实验组与对照组间的定量差异倍数高于预设阈值、定量差异显著性p值或p值校正值低于预设阈值，则判断第3项评估指标通过，反之，则未通过，若第3项评估指标未通过，则判断免疫沉淀实验亲和富集效率不足；所述诱饵蛋白在实验组与对照组间的定量差异倍数的预设阈值在2至10取值；所述定量差异显著性p值或p值校正值的预设阈值为0.01或0.05；
④
诱饵蛋白在免疫沉淀实验组与对照组样品间差异程度的排名小于预设阈值，则判断通过第4项评估指标，反之，则未通过，若第4项评估指标未通过，则判断免疫沉淀实验亲和富集特异性不足；所述诱饵蛋白在免疫沉淀实验组与对照组样品间差异程度的排名的预设阈值在1％至3％，或3至10间取值。9.如权利要求8所述的免疫沉淀实验效果评估系统，其特征在于，所述数据获取模块，在设置对照组实验的情况下，还用于获取蛋白鉴定数量差异和蛋白定量相关系数中一种或多种参数；所述判断模块，还按照如下原则判断：
⑤
蛋白鉴定数量差异和/或总离子色谱图峰面积差异小于预设阈值；和/或蛋白定量相关系数大于预设阈值，则判断第5项评估指标通过评估，反之，则未通过；所述蛋白鉴定数量差异的预设阈值在5％至40％取值；所述总离子色谱图峰面积差异的预设阈值在5％至40％取值；所述蛋白定量相关系数的预设阈值在0.6至0.95取值。10.如权利要求9所述的免疫沉淀实验效果评估系统，其特征在于，所述评估结果显示模块，在设置对照组情况下，显示结果还包括如下：第3项评估指标若未通过，显示免疫沉淀实验亲和富集效率达标，若未通过，显示免疫沉淀亲和富集效率不足；第4项评估指标若通过，显示免疫沉淀实验亲和富集特异性达标，若未通过，显示免疫沉淀实验亲和富集特异性不足；第5项评估指标若通过，显示对照组实验设置合理，若未通过，显示对照组实验设置不合理；若免疫沉淀实验所得样本量、亲和富集效率、亲和富集特异性和对照组设置合理性均达标，说明免疫沉淀实验效果理想，若对应评估指标未通过，说明免疫沉淀实验在对应方面存在缺陷，需要改进。
技术总结
本发明公开了一种基于质谱法评估免疫沉淀实验效果的方法，其包括以下步骤：将获得的免疫沉淀蛋白，采用清洗液清洗、蛋白酶酶解以及脱盐处理，获得可供质谱直接检测的肽段和/或蛋白样品；进行质谱检测，获取质谱图谱的原始数据，搜库解析图谱原始数据，获得肽段和/或蛋白鉴定和定量数据；所述数据包括第1项评估指标样品中总蛋白鉴定和定量情况及第2项评估指标诱饵蛋白定量数据在总蛋白定量列表中的排名；所述评估指标数据，按照如下评估原则进行评估：样品中总蛋白鉴定和定量情况越好，判断免疫沉淀实验样本量越多，效果越好；诱饵蛋白排名越高，判断免疫沉淀实验亲和富集效率和特异性越好。本发明可以快速、准确定量的评估免疫沉淀实验效果。免疫沉淀实验效果。免疫沉淀实验效果。
技术研发人员：尚骏 陈希 韩强强 刘宜子 杜博贾 丁宇翔
受保护的技术使用者：谱度众合（武汉）生命科技有限公司
技术研发日：2022.08.01
技术公布日：2022/11/2