G2、I gG3、I gG4、I gAi 和 I gA2)或子类的。
[0055]如本文所用,"抗体组分"是指特异性结合到表位或抗原且包括一或多个免疫球蛋 白结构特征的多肤元件(可W是完整多肤,或较大多肤,例如如本文所述的融合多肤的一部 分)。一般来说,抗体组分为氨基酸序列包括抗体结合区(例如其抗体轻链或可变区或一或 多个互补决定区("CDR"),或其抗体重链或可变区或一多个CDR,任选地在一或多个构架区 的存在下)的元件特征的任何多肤。在一些实施例中,抗体组分为或包含全长抗体。在一些 实施例中,抗体组分小于全长但包括至少一个结合位点(包含至少一个,且优选地至少两个 具有已知抗体"可变区"的结构的序列)。在一些实施例中,术语"抗体组分"涵盖任何具有与 免疫球蛋白结合域同源或在很大程度上同源的结合域的蛋白质。在特定实施例中,包括的 "抗体组分"涵盖具有显示与免疫球蛋白结合域的至少99%-致性的结合域的多肤。在一些 实施例中,包括的"抗体组分"为任何具有显示与免疫球蛋白结合域,例如参考免疫球蛋白 结合域的至少70 %、75%、80 %、85 %、90 %、95%或98 % -致性的结合域的多肤。包括的"抗 体组分"可W具有与发现于天然来源中的抗体(或其一部分,例如其抗原结合部分)一致的 氨基酸序列。抗体组分可W是单特异性、双特异性或多特异性的。抗体组分可W包括任何免 疫球蛋白类别的结构元件特征,包括人类类别中的任一个:IgG、IgM、IgA、I曲和IgE。已展示 抗体的抗原结合功能可由全长抗体的片段进行。此类抗体实施例也可W是双特异性、双重 特异性或多特异性形式的;特异性地结合到两个或两个W上不同抗原。涵盖在术语抗体的 "抗原结合部分"内的结合片段的实例包括(i)Fab片段,由Vh、化、ChIW及Cl域组成的单价片 段;(ii)F(ab')2片段,包含两个在较链区由二硫桥键连接的化b片段的二价片段;(iii)Fd 片段,由Vh和ChI域组成;(iv)Fv片段,由抗体的单臂的Vh和Vl域组成;(v)dAb片段(沃德 (Ward)等人,(1989)自然(化Uire)341:544-546),所述片段包含单一可变域;W及(vi)经分 离的互补决定区(CDR)。此外,尽管Fv片段的两个域(Vh和化)是通过独立基因编码的,但其可 W使用重组方法通过合成连接子接合,所述连接子使其能够制造成Vh和化区配对W形成单 价分子的单一蛋白链(称为单链Fv(scFv);参见例如,伯德(Bird)等人,(1988)科学 (Science)242 :423-426 ;和休斯顿(Huston)等人,(1988)美国国家科学院院刊85 :5879-5883)。在一些实施例中,如本文所述的"抗体组分"为或包含此类单链抗体。在一些实施例 中,"抗体组分"为或包含双功能抗体。双功能抗体为二价、双特异性抗体,其中Vh和化域在单 一多肤链上表达,但使用过短而不允许相同链上的两个域之间进行配对的连接子,由此迫 使所述域与另一链的互补域配对且产生两个抗原结合位点(参见例如,霍利格尔 化olliger)等人(1993)美国国家科学院院刊90:6444-6448;鲍良克,R.J.等人(1994)结构 2:1121-1123)。此类抗体结合部分为所属领域中已知的(孔特曼化on t ermann)和杜贝尔 (Dubel)编,抗体工程改造 (Antibody Engineering) ( 2001)纽约施普林格出版社 (Springer-Verlag.化W 化rk.)第790页(ISBN3-540-41354-5)。在一些实施例中,抗体组分 为或包含包含一对串联Fv片段(Vh-Ch1-Vh-姑1)的单链"线抗体",所述片段连同互补轻链多 肤形成一对抗原结合区(萨帕塔(Zapata)等人蛋白质工程(Protein Eng. )8(10): 1057-1062( 1995);和美国专利第5,641,870号)。在一些实施例中,抗体组分可W具有嵌合或人类 化抗体的结构元件特征。一般来说,人类化抗体为人类免疫球蛋白(受体抗体),其中来自受 体的互补决定区(CDR)的残基经具有所要特异性、亲和力和能力的来自非人类物种(供体抗 体)(如小鼠、大鼠或兔)的CDR的残基置换。在一些实施例中,抗体组分可W具有人类抗体的 结构元件特征。
[0056] 如本文所用,"生物活性"是指通过相关药剂或实体实现的可观测的生物效应或结 果。举例来说,在一些实施例中,特异性结合相互作用为生物活动。在一些实施例中,生物路 径或事件的调变(例如诱导、增强或抑制)为生物活动。在一些实施例中,生物活动的存在或 程度通过检测由相关生物路径或事件产生的直接或间接产物评估。
[0057] 如本文所用,"双特异性抗体"是指双特异性结合剂,其中至少一个,且通常两个结 合部分为或包含抗体组分。多种不同双特异性抗体结构为所属领域中已知的。在一些实施 例中,为或包含抗体组分的双特异性抗体中的每一结合部分包括Vh和/或化区;在一些此类 实施例中Vh和/或化区为发现于特定单克隆抗体中的那些。在一些实施例中,当双特异性抗 体含有两个抗体组分结合部分时,其各自包括来自不同单克隆抗体的Vh和/或化区。
[0058] 如本文所用,"双特异性结合剂"是指具有两个离散结合部分的多肤剂,所述结合 部分中的每一者与相异的标祀结合。在一些实施例中,双特异性结合剂为单一多肤;在一些 实施例中,双特异性结合剂为或包含多个肤,其在一些此类实施例中可W例如通过交联彼 此共价缔合。在一些实施例中,双特异性结合剂的两个结合部分识别相同标祀(例如抗原) 的不同位点(例如表位);在一些实施例中,其识别不同标祀。在一些实施例中,双特异性结 合剂能够同时结合到具有结构的两个标祀。
[0059] 如本文所用,"载剂"是指投与组合物所用的稀释剂、佐剂、赋形剂或媒剂。在一些 示例性实施例中,载剂可W包括无菌液体,如水和油,包括石油、动物、植物或合成来源的 油,如花生油、大豆油、矿物油、芝麻油等。在一些实施例中,载剂为或包括一或多种固体组 分。
[0060] 如本文中所用,"CDR"是指抗体可变区内的互补决定区。在重链和轻链的每一可变 区中有Ξ个CDR,对于每一可变区,其被指定为CDR1、CDR2和CDR3 /'CDR的组"或乂DR组"是指 在能够结合抗原的单一可变区中存在的Ξ个或六个CDR群组或能够结合抗原的同源重链和 轻链可变区的CDRXDR的界限已取决于系统W不同方式定义,在所述系统中数种是所属领 域中已知的(例如卡己特化abat)、科西亚(化othia)等)。
[0061] 如本文所用,"CDR移植抗体"是指氨基酸序列包含来自一个物种重链和轻链可变 区序列,但其中Vh和/或化的CDR区中的一或多个的序列经另一物种的CDR序列替换的抗体, 如具有鼠类Vh和化区的抗体,其中鼠类CDR中的一或多个(例如CDR3)已经人类CDR序列替换。 同样,"CDR移植抗体"也可W指具有人类Vh和化区的抗体,其中人类CDR中的一或多个(例如 CDR3)已经小鼠 CDR序列替换。
[0062] 如本文所用,"嵌合抗体"是指氨基酸序列包括发现于第一物种中的Vh和化区序列 和发现于不同于第一物种的第二物种中的恒定区序列的抗体。在多个实施例中,嵌合抗体 具有连接到人类恒定区的鼠类Vh和化区。在一些实施例中,具有连接到非人类恒定区(例如 小鼠恒定区)的人类Vh和化区的抗体称为"反向嵌合抗体"。
[0063] 如本文所用,术语"可比的"是指彼此可能并非一致但充分类似W允许在其间比 较,使得可基于所观察到的差异或类似性而合理地得到结论的两种或两种W上药剂、实体、 情形、状况组等。所属领域的技术人员将了解,在情形中,在待视为可比的两种或两种W上 此类药剂、实体、情形、条件组的任何给定情况中需要何种程度的一致性。
[0064] 如本文所用,"二聚化组分"是指当包括于多肤链中时,介导链与也含有二聚化组 分的一或多个其它多肤非共价缔合为高阶络合物的多肤元件。当相互作用多肤链具有相同 序列时,所得缔合高阶络合物称为"同型二聚体"(或"同型多聚体",如果设及两个W上的 链);当相互作用多肤链具有不同序列时,所得缔合络合物称为"异质二聚体"(或"异质多聚 物")。在一些实施例中,二聚化组分的长度为至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、 85、90、95、100或更多个氨基酸。如本文所述,多种潜在二聚化组分为所属领域中已知的。在 一些实施例中,二聚化组分可W包括用于例如通过二硫键形成共价缔合的位点。在某些实 施例中,根据本发明使用的二聚化组分为或包含发现于在引入到除HNF-化W外的多肤中时 介导二聚化的人类HNF-化中的元件。
[0065] 如本文所用,"表位"包括通过免疫球蛋白(例如抗体或受体)结合组分特异性地识 别的任何部分。在一些实施例中,表位包含抗原上的多个化学原子或基团。在一些实施例 中,此类化学原子或基团在抗原采取相关Ξ维构形时经表面暴露。在一些实施例中,此类化 学原子或基团在抗原采取此类构形时在空间上彼此物理接近。在一些实施例中,至少一些 此类化学原子为在抗原采取替代构形(例如经线性化)时彼此物理分离的基团。
[0066] 如本文所用,"赋形剂"是指可W包括于药物组合物中,例如W提供或促进所需一 致性或稳定化效应的非治疗剂。药物赋形剂的合适的实例包括例如淀粉、葡萄糖、乳糖、薦 糖、明胶、麦芽、稻谷、面粉、白聖、硅胶、硬脂酸钢、甘油单硬脂酸醋、滑石、氯化钢、脱脂奶 粉、甘油、丙締、乙二醇、水、乙醇等。
[0067] 如本文所用,"构架"或"构架区"是指减去CDR的可变区的序列。由于CDR序列可W 通过不同系统测定,同样,构架序列相应地经受不同解读。六个CD时尋重链和轻链上的构架 区在每一链上分成四个子区(FR1、FR2、FR3和FR4),其中CDR1安置在FR1与FR2之间,CDR2在 FR2与FR3之间,且CDR3在FR3与FR4之间。在不将特定子区指定为FR1、FR2、FR3或FR4的情况 下,如通过其他构架区提及的构架区表示单一、天然存在的免疫球蛋白链的可变区内的组 合FR。如本文中所用,FR代表四个子区中的一个,FR1例如代表最接近于可变区的氨基末端 并且相对于CDR1的5'的第一框架区,并且FRs代表构成框架区的子区中的两个或两个W上。 [00 6引如本文所用,"宿主细胞"是指已向其中引入外源DNA(重组或W其他方式)的细胞。 所属领域的技术人员在阅读本发明后将理解此类术语不仅指特定受试者细胞,而且指此类 细胞的后代。因为某些修饰可W在后代中由于突变或环境影响而发生,此类子代可能在事 实上与亲本细胞不同,但是仍包括在如本文使用的术语"宿主细胞"的范围内。在一些实施 例中,宿主细胞包括选自适合于表达外源DNA(例如重组核酸序列)的生命界中的任一个的 原核和真核细胞。示例性细胞包括原核生物和真核生物细胞(单细胞或多细胞)、细菌细胞 (例如大肠杆菌、芽抱杆菌属、链霉菌属等的菌株)、分枝杆菌细胞、真菌细胞、酵母细胞(例 如酿酒酵母(S.cerevisiae)、裂殖酵母(S.pombe)、己斯德毕赤酵母(P.pastoris)、嗜甲醇 毕赤酵母(P.methanolica)等)、植物细胞、昆虫细胞(例如SF-9、SF-21、杆状病毒感染的昆 虫细胞、粉纹夜蛾等)、非人类动物细胞、人类细胞或细胞融合物,如融合瘤或四源杂交瘤。 在一些实施例中,细胞为人类、猴、猿、仓鼠、大鼠或小鼠细胞。在一些实施例中,细胞为真核 的且选自W下细胞:C册(例如C册K1、DXB-11 CH0、Veggie-C册)、COS(例如C0S-7)、视网膜 细胞、维罗(Vero)、CV1、肾(例如肥K293、293 邸NA、MSR 293、MDCK、化K、BHK)、海拉化eLa)、 HepG2、WI38、MRC 5、Co 10205、皿 8065、化-60 (例如BHK21)、杰卡特(Jurkat)、道迪(Daudi)、 A431 (表皮)、CV-1、U937、3T3、L细胞、C127细胞、Sp2/0、NS-0、MMT 060562、塞特利氏细胞 (Sertoli cell)、B化3A细胞、HT1080细胞、骨髓瘤细胞、肿瘤细胞和衍生自上述细胞的细 胞系。在一些实施例中,细胞包含一或多个病毒基因,例如表达病毒基因的视网膜细胞(例 如阳R.C6?细胞)。
[0069] 如本文中所用,术语"人类抗体"意图包括具有产生(或组装)自人类免疫球蛋白序 列的可变和恒定区的抗体。在一些实施例中,抗体(或抗体组分)可视为"人类",尽管其氨基 酸序列例如在一或多个CDR并且尤其是CDR3中包括不由人类生殖系免疫球蛋白序列(例如 包括序列变异体,例如可能(原先)已通过体外随机或定点诱变或通过体内体细胞突变引入 的序列变异体)编码的残基或元件。
[0070] "人类化"如所属领域中已知,术语"人类化"常用于指氨基酸序列包括来自在非人 类物种(例如小鼠)中产生的参考抗体的Vh和化区序列而且在那些序列中包括打算使其更 "人类样"(即,与人类生殖系可变序列更类似)的相对于参考抗体的修饰的抗体(或抗体组 分)。在一些实施例中,"人类化"抗体(或抗体组分)是免疫特异性地结合到所关注抗原的抗 体,并且其具有具备实质上如人类抗体的氨基酸序列般的氨基酸序列的构架(FR)区W及具 备实质上如非人类抗体的氨基酸序列般的氨基酸序列的互补决定区(CDR)。人类化抗体包 含实质上所有的至少一个并且通常是两个可变域(。曰6^曰13'少(曰13')2、化6(:^乂),其中所有 或实质上所有的CDR区对应于非人类免疫球蛋白(即供体免疫球蛋白)的CDR区,并且所有或 实质上所有构架区是人类免疫球蛋白共同序列的构架区。在一些实施例中,人类化抗体还 包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分,通常是人类免疫球蛋白恒定区的至少一部分。 在一些实施例中,人类化抗体含有轻链W及至少重链可变域两者。抗体也可W包括重链恒 定区的加、较链、姑2、姑3和任选地姑4区。在一些实施例中,人类化抗体仅含有人类化化区。 在一些实施例中,人类化抗体仅含有人类化Vh区。在某些特定实施例中,人类化抗体含有人 类化Vh和化区。
[0071 ]如本文中所用,"经分离"是指如下物质和/或实体:(1)已与最初产生时与其结合 的至少一些组分分离(无论在自然界中和/或在实验环境中);和/或(2)通过人力设计、产 生、制备和/或制造。经分离物质和/或实体可与约10 %、约20 %、约30 %、约40 %、约50 %、约 60%、约 70%、约80%、约90%、约91 %、约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约 98%、约99%或大于约99%的与其最初结合的其它组分分离。在一些实施例中,经分离药剂 是约80 %、约85 %、约90 %、约91 %、约92 %、约93 %、约94%、约95 %、约96 %、约97 %、约 98%、约99%或大于约99%纯。如本文中所用,物质在其实质上不含其它组分时是"纯的"。 在一些实施例中,如所属领域的技术人员将了解,在与某些其它组分(如一或多种载剂或赋 形剂(例如缓冲剂、溶剂、水等))组合之后,物质仍可被视为"经分离"或甚至"纯";在此类实 施例中,在不包括此类载剂或赋形剂的情况下计算物质的分离或纯度百分比。仅举一例,在 一些实施例中,如存在于自然界中的多肤或聚核巧酸的生物聚合物在W下情况下时视为 "经分离":a)凭借其衍生起源或来源不与伴随其(呈其自然界中的天然状态)的组分中的一 些或全部结合;b)其实质上不含来自在自然界中产生其的物质的相同物质的其它多肤或核 酸;C)通过来自不具在自然界中产生其的物质的细胞或其它表达系统的组分表示或W其它 方式与所述组分结合。因此,举例来说,在一些实施例中,经化学合成或在不同于在自然界 中产生多肤的细胞系统中合成的多肤被视为"经分离"多肤。或者或另外,在一些实施例中, 已经受一或多种纯化技术的多肤就其已与a)在自然界中结合;和/或b)在最初产生时结合 的其它组分分离来说可被视为"经分离"多肤。
[0072] 如本文所用,"Kd"是指来自结合剂与其搭配物(例如抗体或其结合组分所结合的 表位)的络合物的结合剂(例如抗体或其结合组分)的解离常数。
[0073] 如本文所用,"k离"是指从结合剂与其搭配物(例如抗体或其结合组分所结合的表 位)的络合物解离结合剂(例如抗体或其结合组分)的解离速率常数。
[0074] 如本文所用,"k合"是指缔合结合剂(例如抗体或其结合组分)与其搭配物(例如抗 体或其结合组分所结合的表位)的缔合速率常数。
[0075] 如本文所用,"连接子"用于指将不同元件彼此连接的多元件多肤的部分。举例来 说,所属领域的一般技术人员了解结构包括两个或两个W上功能或组织域的多肤通常包括 将此类域彼此连接的此类域之间的氨基酸伸长部。在一些实施例中,多肤包含具有一般形 式S1-L-S2的总体结构的连接子元件,其中S1和S2可相同或不同且表示两个通过连接子彼 此缔合的域。在一些实施例中,连接子的长度为至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、 15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、 80、85、90、95、100或更多个氨基酸。在一些实施例中,连接子的特征在于其趋向于不采用刚 性Ξ维结构,而是向多肤提供柔性。在工程改造多肤(例如)时可恰当地使用的多种不同连 接子元件为所属领域中已知的(参见例如霍利格尔,P.化011 iger,P.)等人(1993)美国国家 科学院院刊(Proc.化 tl. Acad. Sci.USA)90:6444-6448;鲍良克,R.J. (Pol jak,R.J.)等人 (1994)结构(StrucUire)2:1121-1123)。
[0076] 如本文所用,"多价结合剂"是指能够结合到两个或两个W上抗原的结合剂,所述 抗原可W在相同分子或不同分子上。如本文所述的多价结合剂在一些实施例中经工程改造 W具有=个或Ξ个W上抗原结合位点,且通常不为天然存在的蛋白质。如本文所述的多价 结合剂是指能够结合两个或两个W上相关或不相关标祀的结合剂。多价结合剂可W包含单 一抗体组分的多个复本或不同抗体组分的多个复本。此类结合剂能够结合到两个或两个W 上抗原且为四价或多价结合剂。多价结合剂可W另外包含治疗剂,如免疫调节剂、毒素或 RNA酶。如本文所述的多价结合剂在一些实施例中能够同时结合到至少两个具有不同结构 的标祀,例如两个不同抗原、相同抗原上的两个不同表位或半抗原和/或抗原或表位。在多 个实施例中,本发明的多价结合剂为经工程改造 W具有如本文所述的多价结合剂的特征的 蛋白质。本发明的多价结合剂可W是单特异性(能够结合一个抗原)或多特异性(能够结合 两个或两个W上抗原)的,且可W包含两个重链多肤和两个轻链多肤。在一些实施例中,每 一结合位点包含重链可变域和轻链可变域,每个抗原结合位点总共六个CDR参与抗原结合。
[0077] 如本文中所用,术语"核酸"在其最广泛意义上是指并入或可W并入寡核巧酸链中 的任何化合物和/或物质。在一些实施例中,核酸是通过憐酸二醋键并入或可W通过憐酸二 醋键并入寡核巧酸链中的化合物和/或物质。如可从上下文知晓,在一些实施例中,"核酸" 是指个别核酸残基(例如核巧酸和/或核巧);在一些实施例中,"核酸"是指包含个别核酸残 基的寡核巧酸链。在一些实施例中,"核酸"为或包含RNA;在一些实施例中,"核酸"为或包含 DNA。在一些实施例中,核酸是一个或多个天然核酸残基、包含一个或多个天然核酸残基或 由一个或多个天然核酸残基组成。在一些实施例中,核酸是一或多个核酸类似物、包含一个 或多个核酸类似物或由一个或多个核酸类似物组