comparative molecular field analysis比较分子力场分析
1.The three-dimensional quantitative structure-activity relationship between the structure of 22 ti- tle compounds and their retardant activity to rat has been set up by comparative molecular field analysis (CoMFA).通过比较分子力场分析(CoMFA)方法,建立了22个标题化合物对大鼠阻断活性的三维定量结构-活性关系(3D-QSAR)模型。
2.Methods A 3D-QSAR model of thirty-one nonsteroidal progesterone receptor agonists 5-benzylidene-l, 2-dihydro-5H-chromeno[3,4-f] quinolines was established by comparative molecular field analysis (CoMFA) method.方法 利用比较分子力场分析方法,建 立31个非甾体类5-亚苄基类取代-1,2-二氢-5H-苯并吡喃并[3,4-f]喹啉人体内孕酮受体激动剂三维定量构效 模型。
3.Then the model of comparative molecular field analysis (CoMFA) was established by global lowest energy conformation.十站:从报道的2一叫咪酮类＊＊＊F受体酪氨酸激酶抑制剂中选取35个化合物,采用分子全局最低能量构象以最小二乘匹配法叠合分子建立比较分子力场分析(CoMFA)模型。
3)comparative molecular field analysis(CoMFA)比较分子力场分析(CoMFA)
4)CoMFA比较分子力场分析法
1.Progress on CoMFA Research;比较分子力场分析法(CoMFA)的研究新进展
2.Using comparative molecular field analysis(CoMFA)and comparative molecular similarity indices analysis(CoM- SIA),three dimensional structure-activity relationship(3D-QSAR)has been studied on a series of novel tetralin antifungal com- pounds.采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA),系统研究了49个新型四氢萘类化合物抗真菌活性的三维定量构效关系。
3.Using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity in-dices analysis (CoMSIA), three dimensional structure-activity relationship (3D-QSAR) has been studied on a series of novel triazole antifungal compounds.采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA),系统研究了40个新型三唑类化合物抗真菌活性的三维定量构效关系。
5)CoMFA比较分子力场分析方法
1.Methods A 3D-QSAR model of thirty-four SSRIs was established by the comparative molecular field analysis(CoMFA).方法通过确定34个茚胺类化合物分子的药效构象,与模板分子进行分子叠加,利用比较分子力场分析方法(CoMFA),建立了一个选择性SSRIs的三维定量构效模型。
2.METHODS To quantitively disclose the relationship between structure and actitivety of a series of selective serotonin reuptake inhibitors(SSRIs) for 3-Phenyl -1-indan-amines,and build a three dimensional Quantitative structure activity relationship(3D-QSAR) model for the design of novel potent drugs by the comparative molecular field analysis(CoMFA).方法:通过比较分子力场分析方法(CoMFA),建立有较高的预测能力的苯茚胺类似物抗抑郁活性的三维定量构效模型,研究其结构与活性间的关系,指导设计并优化合成出新的化合物,然后用小鼠悬尾实验进行初步的抗抑郁药理活性的筛选,得到具有抗抑郁活性的新的苯茚胺类似物。
3.Specifically,CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship) and CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship) CoMFA(comparative molecular field analysis) studies were carried out on indolocarbazole derivatives as CDK inhibitors.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型。
6)Comparative molecular field analysis (CoMFA)比较分子力场分析(CoMFA)
延伸阅读
分子力场
PCMODEL，一个基于分子力学的计算软件
分子力场根据量子力学的波恩-奥本海默近似，一个分子的能量可以近似看作构成分子的各个原子的空间坐标的函数，简单地讲就是分子的能量随分子构型的变化而变化，而描述这种分子能量和分子结构之间关系的就是分子力场函数。分子力场函数为来自实验结果的经验公式，可以讲对分子能量的模拟比较粗糙，但是相比于精确的量子力学从头计算方法，分子力场方法的计算量要小数十倍，而且在适当的范围内，分子力场方法的计算精度与量子化学计算相差无几，因此对大分子复杂体系而言，分子力场方法是一套行之有效的方法。以分子力场为基础的分子力学计算方法在分子动力学、蒙特卡罗方法、分子对接等分子模拟方法中有着广泛的应用。[编辑]构成一般而言，分子力场函数由以下几个部分构成：键伸缩能：构成分子的各个化学键在键轴方向上的伸缩运动所引起的能量变化键角弯曲能：键角变化引起的分子能量变化二面角扭曲能：单键旋转引起分子骨架扭曲所产生的能量变化非键相互作用：包括范德华力、静电相互作用等与能量有关的非键相互作用交叉能量项：上述作用之间耦合引起的能量变化构成一套力场函数体系需要有一套联系分子能量和构型的函数，还需要给出各种不同原子在不同成键状况下的物理参数，比如正常的键长、键角、二面角等，这些力场参数多来自实验或者量子化学计算。[编辑]常用力场函数和分类不同的分子力场会选取不同的函数形式来描述上述能量与体系构型之间的关系。到目前，不同的科研团队设计了很多适用于不同体系的力场函数，根据他们选择的函数和力场参数，可以分为以下几类传统力场AMBER力场：由Kollman课题组开发的力场，是目前使用比较广泛的一种力场，适合处理生物大分子。CHARMM力场：由Karplus课题组开发，对小分子体系到溶剂化的大分子体系都有很好的拟合。CVFF力场：CVFF力场是一个可以用于无机体系计算的力场MMX力场：MMX力场包括MM2和MM3，是目前应用最为广泛的一种力场，主要针对有机小分子第二代力场
- 第二代的势能函数形式比传统力场要更加复杂，涉及的力场参数更多，计算量也更大，当然也相应地更加准确。
- 通用力场也叫基于规则的力场，它所应用的力场参数是基于原子性质计算所得，用户可以通过自主设定一系列分子作为训练集来生成合用的力场参数
